More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2375 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 324 aa  636    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  70.97 
 
 		 318 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  71.29 
 
 		 318 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  71.29 
 
 		 318 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  69.5 
 
 		 317 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  70.38 
 
 		 314 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  71.24 
 
 		 311 aa  411  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  67.31 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  63.81 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  66.56 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  66.67 
 
 		 311 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  70.13 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  61.78 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  61.64 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  63.09 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  62.06 
 
 		 317 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  63.17 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  61.41 
 
 		 310 aa  346  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  61.86 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  60 
 
 		 311 aa  340  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  58.1 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  61.66 
 
 		 321 aa  333  3e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  59.09 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  60.65 
 
 		 313 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  55.63 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  63.46 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  57.8 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  58.07 
 
 		 443 aa  299  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  57.84 
 
 		 308 aa  298  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  57.4 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  60.91 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  56.37 
 
 		 314 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  55.99 
 
 		 310 aa  278  6e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1758  integrase family protein  57.23 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488752  hitchhiker  0.0032662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  56.47 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  47.21 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.19 
 
 		 299 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  39.74 
 
 		 295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  44.95 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.84 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  45.08 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.56 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  42.35 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.88 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.23 
 
 		 296 aa  241  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.23 
 
 		 296 aa  241  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.23 
 
 		 296 aa  241  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  43.32 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.23 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.23 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.23 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.23 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.23 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.23 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  44.69 
 
 		 302 aa  238  9e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  42.67 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  40.26 
 
 		 296 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  39.17 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  42.67 
 
 		 307 aa  235  9e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  36.81 
 
 		 296 aa  235  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  44 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  42.48 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  44.52 
 
 		 314 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  44.19 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  43.69 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  44.01 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  41.83 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  43.56 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  40.45 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  51.58 
 
 		 316 aa  229  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  45.51 
 
 		 309 aa  228  8e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  42.59 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  42.86 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  37.79 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  37.79 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  40.58 
 
 		 302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  41.04 
 
 		 295 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  42.21 
 
 		 292 aa  222  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  40.65 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  35.9 
 
 		 294 aa  222  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  39.23 
 
 		 296 aa  222  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  43 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  39.94 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  41.5 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  42.68 
 
 		 373 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  40.06 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  39.61 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  39.42 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  41.87 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  41.27 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  38.7 
 
 		 322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  44.37 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  43.32 
 
 		 293 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  40.13 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  39.8 
 
 		 298 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  43.14 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  39.48 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  38.24 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>