More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3139 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  100 
 
 		 344 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  58.26 
 
 		 346 aa  329  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  56.79 
 
 		 362 aa  328  8e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  60.26 
 
 		 310 aa  328  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  60.37 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.57 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.57 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.57 
 
 		 318 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.25 
 
 		 317 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  59.75 
 
 		 318 aa  318  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.37 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.8 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  61.09 
 
 		 313 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.23 
 
 		 321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  58.52 
 
 		 311 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  57.32 
 
 		 324 aa  300  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  58.9 
 
 		 308 aa  298  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  59.74 
 
 		 311 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  54.78 
 
 		 317 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.8 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  60.33 
 
 		 311 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  56.69 
 
 		 315 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  58.39 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  55.33 
 
 		 353 aa  279  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  54.34 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  55.03 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  55.86 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  55.42 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  51.94 
 
 		 306 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  56.39 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.37 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  49.51 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  53 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  43.23 
 
 		 319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.41 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  45.14 
 
 		 308 aa  237  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  48.63 
 
 		 295 aa  236  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  37.66 
 
 		 295 aa  232  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.58 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  40.97 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  39.32 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  45.86 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  51.03 
 
 		 443 aa  228  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.79 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.7 
 
 		 296 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.04 
 
 		 296 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.04 
 
 		 296 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.04 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.04 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.04 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.04 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.04 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  47.06 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.7 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.7 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  44.64 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  44.79 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  45.45 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  44.1 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  44.25 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  35.69 
 
 		 296 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  40 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  38.05 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  43.26 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1758  integrase family protein  54.19 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488752  hitchhiker  0.0032662 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 		 295 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  39.8 
 
 		 296 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 		 295 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  35.37 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  38.98 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  35.71 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  42.76 
 
 		 295 aa  212  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  39.42 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  43.06 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  50.16 
 
 		 316 aa  209  8e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  40.2 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  41.27 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  40.95 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  38.1 
 
 		 304 aa  205  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  38.82 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  41.51 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  39.46 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  41.61 
 
 		 303 aa  203  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  37.42 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  38.16 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  36.14 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  39.13 
 
 		 302 aa  202  8e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  37.99 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  39.3 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.1 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.1 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.1 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  39.13 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  39.86 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  39.33 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  37.85 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  40 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  42.21 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>