More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1489 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 313 aa  609  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  80.06 
 
 		 308 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  75.74 
 
 		 321 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  67.1 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  67.42 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  66.77 
 
 		 311 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  67.42 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  68.18 
 
 		 315 aa  378  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  66.13 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  66.13 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  66.56 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  65.08 
 
 		 331 aa  362  6e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  65.47 
 
 		 311 aa  359  3e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  64.63 
 
 		 311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  64.54 
 
 		 328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  66.45 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  62.99 
 
 		 310 aa  348  5e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  60.26 
 
 		 362 aa  341  9e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  60.45 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  60.65 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  58.5 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  57.28 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  58.82 
 
 		 306 aa  325  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  61.29 
 
 		 314 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  61.06 
 
 		 313 aa  320  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  59.46 
 
 		 353 aa  316  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  63.23 
 
 		 299 aa  314  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  66.03 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  62.9 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  61.97 
 
 		 321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  57.96 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  61.09 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  54.81 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1758  integrase family protein  58.99 
 
 		 383 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488752  hitchhiker  0.0032662 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  55.52 
 
 		 332 aa  276  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  48.08 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.34 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  40.13 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.23 
 
 		 296 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  44.48 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.26 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  43.18 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.26 
 
 		 296 aa  245  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.26 
 
 		 296 aa  245  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.26 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.26 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.26 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.26 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.26 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.94 
 
 		 296 aa  242  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.94 
 
 		 296 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  47.87 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  43.46 
 
 		 319 aa  241  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  46.2 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  48.52 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  44.12 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  37.99 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  46.93 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  44.08 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.23 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  45.54 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  42.67 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  43.71 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.58 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  39.1 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  46.56 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  39.41 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.26 
 
 		 299 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.26 
 
 		 299 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  44.63 
 
 		 302 aa  229  6e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.26 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.26 
 
 		 299 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.26 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.94 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.94 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  41.83 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  50.64 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  41.02 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.94 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  43.15 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  43.54 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  41.83 
 
 		 307 aa  225  6e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  44.55 
 
 		 292 aa  225  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  40.2 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  42.66 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.29 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  43.89 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  41.5 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  47.9 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  47.9 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  37.26 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  41.5 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  43 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  43 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  43 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  43 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  43 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  43 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  43 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  43.61 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>