More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_14190 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 
321 aa  627  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  68.98 
 
 
346 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  65.47 
 
 
362 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  63.01 
 
 
315 aa  361  8e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  63.52 
 
 
318 aa  360  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  62.3 
 
 
324 aa  348  7e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  62.09 
 
 
311 aa  345  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  63.09 
 
 
321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.02 
 
 
318 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.02 
 
 
318 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  63.26 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.72 
 
 
318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  63.21 
 
 
331 aa  334  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.25 
 
 
317 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.97 
 
 
314 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  60.64 
 
 
353 aa  328  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.99 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  59.94 
 
 
313 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  59.8 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  60.73 
 
 
311 aa  317  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  61.06 
 
 
345 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  61.97 
 
 
313 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  55.31 
 
 
306 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  53.75 
 
 
301 aa  308  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  61.31 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  59.74 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  63.37 
 
 
299 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  58.28 
 
 
308 aa  298  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  56.72 
 
 
310 aa  291  9e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.75 
 
 
325 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.05 
 
 
299 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.86 
 
 
298 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  47.35 
 
 
295 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  56.48 
 
 
344 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  54.38 
 
 
443 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  54.26 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  49.01 
 
 
295 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  53 
 
 
314 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  46.77 
 
 
308 aa  255  6e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.59 
 
 
296 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.59 
 
 
296 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.92 
 
 
296 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.59 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.59 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.59 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.59 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.59 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.59 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.59 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.59 
 
 
296 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  41 
 
 
295 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  40.33 
 
 
296 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  43.05 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  42.68 
 
 
319 aa  238  9e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  45.1 
 
 
294 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  37.74 
 
 
295 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  43.65 
 
 
297 aa  237  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1758  integrase family protein  52.81 
 
 
383 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488752  hitchhiker  0.0032662 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  40.63 
 
 
302 aa  237  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  45.51 
 
 
320 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  44.85 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  41.99 
 
 
307 aa  233  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  41.35 
 
 
307 aa  232  6e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  40.19 
 
 
307 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  45.03 
 
 
292 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  44.52 
 
 
295 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  43.04 
 
 
295 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  47.04 
 
 
302 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  43.87 
 
 
302 aa  228  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  39.93 
 
 
296 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  40.57 
 
 
306 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  35.76 
 
 
296 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  38.89 
 
 
297 aa  227  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  40.52 
 
 
302 aa  225  7e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  41.04 
 
 
302 aa  225  7e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  42.38 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  36.45 
 
 
295 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  36.45 
 
 
295 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  40.2 
 
 
302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.59 
 
 
298 aa  222  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  44.87 
 
 
298 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 
302 aa  222  7e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  44.16 
 
 
308 aa  222  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  40.26 
 
 
305 aa  222  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  40.59 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.59 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  42.59 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.59 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  33.87 
 
 
294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.59 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.59 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  40.72 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.59 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  42.59 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.59 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.27 
 
 
298 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 
277 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  44.55 
 
 
314 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  39.81 
 
 
304 aa  218  8.999999999999998e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  43.77 
 
 
317 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>