More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0818 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  100 
 
 
296 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  81.63 
 
 
298 aa  507  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  81.63 
 
 
298 aa  507  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.64 
 
 
299 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.64 
 
 
299 aa  279  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.3 
 
 
299 aa  279  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.26 
 
 
300 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.3 
 
 
299 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.3 
 
 
299 aa  278  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.3 
 
 
299 aa  278  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.3 
 
 
299 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.3 
 
 
299 aa  278  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.3 
 
 
299 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.96 
 
 
301 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.62 
 
 
299 aa  275  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.24 
 
 
300 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  45.49 
 
 
300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  39.8 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  41.67 
 
 
307 aa  221  9e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  38.1 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  39.02 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  40 
 
 
290 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  39.08 
 
 
307 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  38.19 
 
 
317 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  40.34 
 
 
311 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  38.16 
 
 
332 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  39.6 
 
 
307 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  39.6 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  39.6 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  40.47 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  37.42 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  39.06 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  39.65 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  39.86 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  37.16 
 
 
294 aa  211  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  39.86 
 
 
293 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.83 
 
 
296 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  41.3 
 
 
299 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  41.78 
 
 
300 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.31 
 
 
299 aa  208  9e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.49 
 
 
296 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.49 
 
 
296 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  36.36 
 
 
310 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 
296 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  39.74 
 
 
302 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  38.8 
 
 
302 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  38.3 
 
 
295 aa  206  4e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  37.97 
 
 
295 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.8 
 
 
296 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.8 
 
 
296 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.8 
 
 
296 aa  205  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.8 
 
 
296 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  38.54 
 
 
342 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  39.14 
 
 
302 aa  205  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.8 
 
 
296 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  39.07 
 
 
302 aa  205  7e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.8 
 
 
296 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.8 
 
 
296 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  38.41 
 
 
302 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  37.41 
 
 
296 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  36.91 
 
 
295 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  36.52 
 
 
303 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.57 
 
 
298 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  37.58 
 
 
307 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  35.93 
 
 
305 aa  203  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  38.13 
 
 
296 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 
301 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  35.69 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  37.71 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  38.01 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  35.59 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.88 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  35.59 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  35.67 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  37.11 
 
 
302 aa  200  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  37.12 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  37.93 
 
 
343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  37.07 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.9 
 
 
298 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  35.59 
 
 
295 aa  199  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 
298 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.55 
 
 
300 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 
298 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  37.59 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  34.58 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.99 
 
 
333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.21 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.21 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  35.43 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  35.49 
 
 
300 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.99 
 
 
316 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  37.15 
 
 
312 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.39 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  35.56 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.39 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.39 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  37.76 
 
 
294 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.76 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  36.05 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.39 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>