More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0918 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0918  integrase  100 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  49.15 
 
 		 300 aa  305  6e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  45.67 
 
 		 307 aa  275  5e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.44 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.1 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.78 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.1 
 
 		 299 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.1 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.1 
 
 		 299 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.44 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.76 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.76 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.44 
 
 		 301 aa  258  9e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.1 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.48 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.14 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  42.09 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.25 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  40.82 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.23 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  39.06 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  38.64 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  38.59 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  40 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  35.93 
 
 		 316 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.33 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.33 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.67 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.67 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.67 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.67 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  39.07 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.67 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.67 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.67 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  37.58 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.33 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  38.67 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.33 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  38.56 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.33 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  36.91 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  38.97 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  40.2 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  37.37 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  37.67 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  38.93 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  37.58 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  38.38 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  38.33 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  38.8 
 
 		 342 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  37 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  37.04 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  36.33 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  37.29 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  37.29 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  37.67 
 
 		 299 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  36.95 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  38.72 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  36.99 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  36.36 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  36 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  38.41 
 
 		 343 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  36.64 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  37.62 
 
 		 302 aa  195  6e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  37.02 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  38.08 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  36.64 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  34.78 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.79 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.79 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  36.86 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  36.82 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  35.93 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  35.15 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  35.93 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  34.11 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  37.37 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  34.68 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  36.39 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  38.33 
 
 		 321 aa  192  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  35.59 
 
 		 295 aa  192  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  38.06 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  36.49 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  36.18 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  35.13 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  37.02 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  36.08 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  36.88 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  37.92 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  36.08 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  34.22 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  36.45 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.14 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  35.27 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.11 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>