More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2497 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  100 
 
 		 308 aa  629  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  47.99 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  49.66 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  48.47 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  48.46 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  48.12 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  45.55 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  41.98 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  43.91 
 
 		 312 aa  237  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  43.3 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  43 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  41.84 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  42.36 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  41.92 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  42.86 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  38.83 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  37.25 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  40.54 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  41.28 
 
 		 311 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  40.33 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  41.24 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  38.71 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  39.12 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  39.94 
 
 		 335 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  39.32 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  40.82 
 
 		 307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  39.67 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  38.13 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  38.33 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  39.73 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  42.62 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  37.41 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  42.62 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  39.12 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  40.14 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.79 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.79 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.79 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.79 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  38.74 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  40.4 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  39.25 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  40.14 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  39.8 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  38.74 
 
 		 309 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.07 
 
 		 299 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  41.61 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.79 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  40.47 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  40.27 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  39.07 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  40 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.89 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  38.33 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  38.49 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  38.74 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  38.41 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.07 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  38.74 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  39.87 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  40 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  40.4 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  39.42 
 
 		 395 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  39.06 
 
 		 300 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.33 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  37.33 
 
 		 300 aa  205  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.29 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  39.61 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  39.8 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  36.77 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.83 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  37 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  38.93 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  39 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.31 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  37.33 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  38.49 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.49 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.49 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.49 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.49 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  41.89 
 
 		 343 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  39 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  41.89 
 
 		 343 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  37 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  39.23 
 
 		 321 aa  202  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.14 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  38.14 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  39.73 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  38.91 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.86 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.75 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.13 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>