More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0574 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  100 
 
 		 304 aa  605  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  51.32 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  53.16 
 
 		 317 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  50 
 
 		 301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  49.66 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  45.07 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  46.67 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  45.79 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.54 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  41.45 
 
 		 296 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  43.42 
 
 		 295 aa  245  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.54 
 
 		 298 aa  245  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  43.61 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  45.9 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  45.25 
 
 		 293 aa  242  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  45.25 
 
 		 294 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  40.46 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  44.48 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  45.51 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  43.28 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  41.12 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  42.63 
 
 		 302 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  44.85 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  45.67 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.75 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.75 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  40.79 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.42 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.41 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.41 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.75 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  40.46 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.75 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.75 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.75 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.75 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.86 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.86 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.86 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.86 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  44.33 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.2 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.2 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.86 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.86 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.86 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.09 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.2 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  37.17 
 
 		 294 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  43.09 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  43 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.53 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  44.52 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  40.79 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  41.97 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  41.31 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  44.33 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  40.33 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  42.43 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  41.72 
 
 		 310 aa  221  9e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  42.76 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  39.4 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  40.13 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  38.54 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  40.92 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  44.82 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  42.52 
 
 		 310 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  40.33 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  40.33 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  39 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  39.73 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  44.15 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  44.15 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  39.41 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.73 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  41.12 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  42.14 
 
 		 306 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  38.41 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  40.85 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  42.19 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  41.33 
 
 		 321 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  41.83 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  40.13 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  40.65 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  43.23 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  39.87 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  42 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  40.79 
 
 		 292 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 321 aa  208  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  42.9 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  41.78 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  41.14 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  40.72 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  42.58 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  42.86 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  38.33 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  38.49 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  39 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.06 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  41.31 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>