More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4828 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  100 
 
 		 433 aa  882    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  54.4 
 
 		 390 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  46.05 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  48.8 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  42.79 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  41.67 
 
 		 370 aa  255  9e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  45.14 
 
 		 367 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  35.7 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  37.13 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  39.78 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  34.57 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  35.71 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  33.52 
 
 		 383 aa  163  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  33.63 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  31.27 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  30.89 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  30.18 
 
 		 394 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  32.13 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  27.7 
 
 		 422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.51 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  25.19 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 368 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.59 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3333  hypothetical protein  44.14 
 
 		 182 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  26.59 
 
 		 451 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  27.2 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.4 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  31.45 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.61 
 
 		 377 aa  96.7  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  27.6 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.3 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.37 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.99 
 
 		 325 aa  94.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  25.24 
 
 		 405 aa  93.2  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.84 
 
 		 378 aa  91.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12333  integrase  40.79 
 
 		 151 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.12 
 
 		 369 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.79 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.79 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.37 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  28.26 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.16 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  30.04 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 373 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.37 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  21.92 
 
 		 384 aa  87.8  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  24.16 
 
 		 381 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  26.13 
 
 		 407 aa  86.7  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 295 aa  86.3  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  30.49 
 
 		 396 aa  86.3  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  23.26 
 
 		 293 aa  86.3  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.16 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  29.59 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.42 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  27.61 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.13 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.93 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.21 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  26.9 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  23.16 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.33 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  23.13 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.27 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.27 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.8 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  26.1 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  24.83 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.87 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.35 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.32 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.32 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.51 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.41 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.85 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13783  integrase  69.09 
 
 		 71 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.763684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.19 
 
 		 305 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  23.68 
 
 		 344 aa  79.7  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  27.6 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  27.02 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  29.05 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.25 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.79 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.22 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  25.62 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.57 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  21.92 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.18 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.28 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.71 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>