More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5760 on replicon NC_011760
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011760  Mchl_5760  integrase family protein  100 
 
 		 291 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  54.36 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  40.65 
 
 		 294 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  39.71 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  39.35 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  37.58 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  30.47 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.43 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.9 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.9 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.45 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  34.32 
 
 		 315 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  32.98 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  36.17 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  31.1 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  35.25 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  32.72 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.11 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  27.84 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  32.32 
 
 		 343 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  33.7 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  32.32 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  29.89 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  29.08 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.32 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  31.34 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  32.6 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  30.4 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  33.09 
 
 		 294 aa  106  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.21 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  34.02 
 
 		 322 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  34.33 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  28.41 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  29.35 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.09 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.78 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  26.79 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.78 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.1 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  24.15 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.78 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.1 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  29.43 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  32.3 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.84 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.87 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  28.94 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.19 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  30.24 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  30.03 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  32.71 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  34.95 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  31.14 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.88 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.74 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  32.78 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.5 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  31.95 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  32.1 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  32.76 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  31.4 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  29.86 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  34.63 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  27.11 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  31.86 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  31.44 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.06 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.63 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  33.92 
 
 		 315 aa  99.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 323 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  32.5 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  30.38 
 
 		 322 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  28.41 
 
 		 304 aa  99.4  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.1 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  30.36 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.52 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  34.57 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  31.08 
 
 		 313 aa  99  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  35.53 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  30.48 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  33.49 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  29.5 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.24 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  35.27 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2237  site-specific recombinase XerD-like  38.61 
 
 		 225 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0311543  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  29.9 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  30.4 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>