More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8918 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8918  integrase family protein  100 
 
 		 492 aa  1018    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0126697  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  43.71 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3873  integrase family protein  42.57 
 
 		 439 aa  347  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00124247  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  34.86 
 
 		 368 aa  170  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1593  putative tyrosine recombinase XerD  35.16 
 
 		 184 aa  120  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  51.28 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  22.84 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.78 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  26.69 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.73 
 
 		 365 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  22.57 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  24.32 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  26.44 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  24.89 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  23.59 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.12 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  23.72 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  22.89 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1562  LacI family transcription regulator  24.72 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.579473  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.8 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  22.02 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  26.91 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.98 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.98 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  27.9 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25.17 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  50 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  23.98 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  21.5 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1423  integrase family protein  22.85 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00313784  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  54 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  25.65 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  50 
 
 		 318 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 395 aa  57  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  50 
 
 		 318 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  24.26 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.6 
 
 		 376 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  24.84 
 
 		 381 aa  56.6  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  47.06 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  50 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  48.15 
 
 		 313 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.49 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  50 
 
 		 317 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.08 
 
 		 376 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  45.59 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.08 
 
 		 376 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.05 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  24.63 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  39.05 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  48.15 
 
 		 318 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  46.3 
 
 		 299 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  49.06 
 
 		 315 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.46 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  42.86 
 
 		 402 aa  54.7  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  39.06 
 
 		 305 aa  54.7  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  29.79 
 
 		 451 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  35.85 
 
 		 311 aa  53.9  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  53.06 
 
 		 321 aa  53.9  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  37.89 
 
 		 354 aa  53.5  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  47.17 
 
 		 318 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  19.63 
 
 		 386 aa  53.5  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  25.1 
 
 		 357 aa  53.5  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  47.37 
 
 		 324 aa  53.5  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  34.34 
 
 		 317 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  21.4 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  49.06 
 
 		 362 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.3 
 
 		 314 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  22.53 
 
 		 402 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.18 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  24.38 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  32.32 
 
 		 297 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  35.05 
 
 		 294 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  54.35 
 
 		 316 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  33.96 
 
 		 308 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.77 
 
 		 378 aa  52  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  47.17 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 385 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  42.67 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  40.28 
 
 		 319 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  43.33 
 
 		 295 aa  50.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  46 
 
 		 316 aa  50.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  39.34 
 
 		 323 aa  50.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  48.89 
 
 		 311 aa  50.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  38.61 
 
 		 314 aa  50.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  43.33 
 
 		 302 aa  50.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  25.36 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25 
 
 		 369 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.32 
 
 		 369 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.33 
 
 		 321 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  51.06 
 
 		 302 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  43.33 
 
 		 302 aa  50.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  43.33 
 
 		 302 aa  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  47.83 
 
 		 304 aa  50.1  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 		 298 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  48.89 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  32.08 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  47.83 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>