More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2219 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  100 
 
 
378 aa  771    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  57.52 
 
 
379 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  51.72 
 
 
377 aa  353  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  39.95 
 
 
392 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  40 
 
 
390 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  38.3 
 
 
400 aa  276  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  39.88 
 
 
363 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  43.53 
 
 
377 aa  256  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  38.69 
 
 
414 aa  254  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  39.23 
 
 
477 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  36.36 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  35.32 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  38.17 
 
 
370 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  36.21 
 
 
374 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  36.21 
 
 
374 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  38.29 
 
 
325 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  37.89 
 
 
431 aa  223  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  36.06 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  37.44 
 
 
422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  36.32 
 
 
422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  34.49 
 
 
370 aa  215  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  42.18 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  38.23 
 
 
402 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  35.97 
 
 
368 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  33.24 
 
 
369 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  33.43 
 
 
369 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  35.08 
 
 
381 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  33.87 
 
 
392 aa  203  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  37.97 
 
 
386 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  34.38 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  36.94 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  36.94 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  32.56 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  35.32 
 
 
426 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  33.24 
 
 
435 aa  196  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  35.81 
 
 
371 aa  195  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  34.2 
 
 
373 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  37.92 
 
 
383 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  33.96 
 
 
388 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  37.85 
 
 
391 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  32.79 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  35.42 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  35.57 
 
 
378 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  32.56 
 
 
503 aa  170  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  31.15 
 
 
463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  34.6 
 
 
409 aa  166  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  32.82 
 
 
437 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.63 
 
 
443 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  31.17 
 
 
406 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  32.81 
 
 
357 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  30.73 
 
 
416 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  31.09 
 
 
407 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  27.82 
 
 
451 aa  153  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  37.63 
 
 
397 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  29.23 
 
 
381 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  37.01 
 
 
365 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  28.69 
 
 
381 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  33.24 
 
 
374 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  30.03 
 
 
506 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  31.38 
 
 
403 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.49 
 
 
376 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  35.47 
 
 
471 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.49 
 
 
376 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  35.47 
 
 
471 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  27.75 
 
 
442 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  31.63 
 
 
367 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  34.73 
 
 
393 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  30.77 
 
 
507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  31.06 
 
 
487 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  27.53 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  28.92 
 
 
376 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  26.86 
 
 
386 aa  133  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.17 
 
 
389 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.45 
 
 
378 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  31.23 
 
 
656 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.93 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  31.01 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  33.33 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.14 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  30 
 
 
494 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  29.86 
 
 
380 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.65 
 
 
387 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  27.86 
 
 
387 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  50.43 
 
 
121 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  28.37 
 
 
388 aa  113  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.65 
 
 
393 aa  112  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  33.23 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  25.7 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.13 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  29.63 
 
 
407 aa  109  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  39.52 
 
 
429 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  25 
 
 
393 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.64 
 
 
384 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  24.93 
 
 
460 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  26.94 
 
 
508 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  26.94 
 
 
508 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.36 
 
 
376 aa  105  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  32.96 
 
 
275 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  27.22 
 
 
409 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.93 
 
 
392 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>