More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0829 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0829  integrase  100 
 
 
388 aa  803    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  47.63 
 
 
393 aa  311  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  44.17 
 
 
393 aa  292  5e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  37.85 
 
 
398 aa  264  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.68 
 
 
381 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.46 
 
 
477 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.68 
 
 
363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  31.01 
 
 
370 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  29.08 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.28 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.44 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.44 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.2 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.58 
 
 
391 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  30.46 
 
 
435 aa  124  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  28.53 
 
 
362 aa  124  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.87 
 
 
384 aa  123  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  29.43 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  24.26 
 
 
443 aa  120  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.54 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.27 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.61 
 
 
377 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.69 
 
 
391 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  28.92 
 
 
381 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.68 
 
 
357 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  28.4 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.01 
 
 
377 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.55 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  28.37 
 
 
378 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  27.15 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  30.91 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.59 
 
 
379 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.53 
 
 
325 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.68 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.06 
 
 
416 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  24.92 
 
 
404 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.52 
 
 
385 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1417  integrase  27.49 
 
 
415 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  24.92 
 
 
371 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  33.17 
 
 
374 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.9 
 
 
451 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.34 
 
 
389 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.14 
 
 
392 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  31.33 
 
 
383 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.84 
 
 
454 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  27.51 
 
 
386 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  23.87 
 
 
376 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  26.83 
 
 
460 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.97 
 
 
386 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.3 
 
 
387 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.93 
 
 
388 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.95 
 
 
383 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  28.62 
 
 
423 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.74 
 
 
376 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.1 
 
 
392 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.91 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.6 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.6 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  23.76 
 
 
463 aa  96.3  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  25.74 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  24.85 
 
 
397 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.62 
 
 
413 aa  93.6  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.52 
 
 
392 aa  93.2  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.93 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  33.68 
 
 
209 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  24.86 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25.15 
 
 
308 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  23.71 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  25.94 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.94 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  32.41 
 
 
307 aa  89.7  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  32.26 
 
 
310 aa  89.7  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.34 
 
 
368 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  24.46 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  24.41 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  27.86 
 
 
375 aa  86.7  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  26.84 
 
 
368 aa  86.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  25.47 
 
 
402 aa  86.3  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  24.47 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  24.22 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  25.4 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  28.16 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  24.37 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.16 
 
 
443 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  28.24 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  23.79 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  23.81 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  25.68 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  27.58 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  24.09 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  31.8 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.08 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.17 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  22.53 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  20.51 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  24.18 
 
 
656 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  26.41 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  27.06 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  31.21 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  20.71 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>