More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2967 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  100 
 
 
379 aa  750    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  100 
 
 
379 aa  750    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  48.81 
 
 
377 aa  332  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  37.8 
 
 
477 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  33.07 
 
 
390 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  32.82 
 
 
400 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  36.94 
 
 
378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  36.76 
 
 
414 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  37.57 
 
 
371 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  36.36 
 
 
379 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  33.24 
 
 
391 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  29.84 
 
 
392 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  37.13 
 
 
422 aa  186  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  33.76 
 
 
431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  34.67 
 
 
422 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  33.16 
 
 
387 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  36.93 
 
 
383 aa  172  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  33.33 
 
 
363 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  33.86 
 
 
416 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  36.34 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  31.16 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  34.47 
 
 
377 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  30.86 
 
 
370 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  31.33 
 
 
325 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  30.93 
 
 
385 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  28.38 
 
 
383 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  31.75 
 
 
381 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  35.31 
 
 
305 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  35.74 
 
 
391 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.31 
 
 
374 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.31 
 
 
374 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  30.6 
 
 
392 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  36.57 
 
 
378 aa  146  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  31.02 
 
 
426 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.61 
 
 
369 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  36.32 
 
 
388 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  32.21 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.61 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  30.03 
 
 
386 aa  137  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  33.52 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  38.68 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  30.43 
 
 
373 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  38.68 
 
 
471 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  29.63 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.53 
 
 
435 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  27.54 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  30.56 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  33.46 
 
 
367 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.74 
 
 
369 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  35.6 
 
 
365 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  35.02 
 
 
397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  29.88 
 
 
368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  29.95 
 
 
463 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  29.77 
 
 
357 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  30.52 
 
 
391 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.27 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  32.72 
 
 
409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25 
 
 
381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  30.03 
 
 
487 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.31 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.71 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  28.29 
 
 
406 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.92 
 
 
378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  31.7 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  29.27 
 
 
507 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.17 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  28.57 
 
 
387 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  28.46 
 
 
506 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  29.04 
 
 
376 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  33.96 
 
 
370 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.91 
 
 
403 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  26.02 
 
 
460 aa  105  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  29.46 
 
 
656 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  26.58 
 
 
308 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  32.58 
 
 
395 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  30.77 
 
 
454 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  27.51 
 
 
370 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  28.53 
 
 
494 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  29.66 
 
 
422 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.73 
 
 
385 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.18 
 
 
376 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.18 
 
 
376 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  28.1 
 
 
376 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.16 
 
 
398 aa  99  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  26.33 
 
 
492 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  27.41 
 
 
443 aa  97.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  26.98 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  27.65 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  28.83 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  27.32 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.35 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  26.35 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.94 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  29.07 
 
 
380 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  27.68 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  28.51 
 
 
442 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  25.56 
 
 
354 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  28.73 
 
 
209 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  28.51 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  28.57 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>