More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1724 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  100 
 
 		 378 aa  752    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  39.02 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  39 
 
 		 361 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  40.77 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  35.73 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  36.47 
 
 		 397 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  36.26 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  35.22 
 
 		 433 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  31.93 
 
 		 422 aa  159  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  34.21 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  31.84 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  33.98 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  32.36 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  29.35 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  28.91 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  30.69 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.14 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  30.75 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  29.02 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.49 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.8 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.81 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  28.53 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.27 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.47 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.91 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  28.37 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  27.63 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.48 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.64 
 
 		 391 aa  99.8  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  29.24 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  25.68 
 
 		 453 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.19 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  28.47 
 
 		 398 aa  96.3  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  26.39 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.21 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.05 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.32 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.72 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.75 
 
 		 275 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  30.29 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  28.96 
 
 		 471 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.35 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.74 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  26.3 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.37 
 
 		 305 aa  89.7  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  31.07 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.76 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.36 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.25 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.42 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.24 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  24.55 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30.34 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  26.84 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  28.02 
 
 		 451 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.88 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.98 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  26.95 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  28.43 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.97 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.46 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.39 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.72 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  31.49 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.93 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  26.5 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.3 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.8 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.81 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  26.33 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  28.08 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.74 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  29.35 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  26.62 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  26.49 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25.56 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  29.25 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.9 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  31.12 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  29.05 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.71 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.9 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  29.3 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>