More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0524 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  100 
 
 		 407 aa  836    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0272  phage integrase  42.02 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000104155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  33.51 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  33.68 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  29.95 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  28.92 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  34.68 
 
 		 242 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  28.02 
 
 		 447 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.66 
 
 		 363 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  26.73 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  27.22 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  23.4 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  31.12 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  33.54 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  32.52 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  32.52 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  26.33 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  29.13 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.46 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  28.36 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  26.42 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.25 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  29.59 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.82 
 
 		 325 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.85 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  27.89 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.81 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.7 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.92 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  28.65 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.92 
 
 		 377 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  28.5 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  25.68 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.71 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  27.82 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2334  integrase family protein  26.33 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.74243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  24.65 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.95 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.95 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.95 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.95 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  25.77 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.95 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.95 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.95 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  28.57 
 
 		 460 aa  67  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  27.75 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.64 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  26.49 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.65 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.62 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  25.23 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  27.06 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  28.07 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.86 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  31.14 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  28.95 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  25.96 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0255  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.23 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0225677  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  26.59 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.78 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  24.82 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.46 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  27.15 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  23.47 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2011  integrase family protein  28.22 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  25.41 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.32 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.89 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  23.97 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  22.99 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.01 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  21.91 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  25.47 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.04 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  25.6 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  25.93 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  28.98 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.92 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  30.86 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.78 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.78 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  28.64 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  27.16 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.24 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  26.63 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.32 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>