More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1351 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  100 
 
 
416 aa  836    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  33.25 
 
 
390 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  36.29 
 
 
477 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  30.03 
 
 
391 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  34.49 
 
 
387 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.3 
 
 
374 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.3 
 
 
374 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  33.07 
 
 
414 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  33.09 
 
 
377 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  30.75 
 
 
370 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  30.73 
 
 
378 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.97 
 
 
392 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.01 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  31.13 
 
 
363 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  33.33 
 
 
403 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  33.33 
 
 
377 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  29.26 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.8 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  31.21 
 
 
325 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  29.28 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  30.13 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  31.17 
 
 
409 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  31.81 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  30.56 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  30.56 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  28.43 
 
 
383 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  28.83 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  29.1 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  29.48 
 
 
383 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  29.09 
 
 
431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  26.47 
 
 
388 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  31.77 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  31.21 
 
 
404 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.05 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  30.97 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  30.64 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  30.19 
 
 
422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.23 
 
 
369 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  29.4 
 
 
387 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.38 
 
 
373 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  29.49 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  29.01 
 
 
487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.71 
 
 
369 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.97 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  29.46 
 
 
385 aa  111  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  28.3 
 
 
422 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.87 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.78 
 
 
385 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  29.05 
 
 
371 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  32.4 
 
 
471 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  32.4 
 
 
471 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.82 
 
 
391 aa  106  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  28.21 
 
 
305 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  30.39 
 
 
406 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.68 
 
 
376 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  27.86 
 
 
508 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  27.86 
 
 
508 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.38 
 
 
376 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.38 
 
 
376 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.4 
 
 
413 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.74 
 
 
384 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.72 
 
 
392 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.18 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.29 
 
 
367 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  34 
 
 
201 aa  96.7  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  25.2 
 
 
656 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.25 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  28.26 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.33 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.92 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  27.27 
 
 
442 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  27.27 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  24.54 
 
 
494 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  23.06 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  25.61 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  26.16 
 
 
492 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  27.63 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.32 
 
 
381 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  24.29 
 
 
370 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  26.98 
 
 
437 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  23.67 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.48 
 
 
451 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.99 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  26.89 
 
 
393 aa  82  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  22.57 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  27.79 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  26.82 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  26.56 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  28.01 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  22.7 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.77 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  28.79 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.54 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  28.3 
 
 
391 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  26.51 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  21.91 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  25.07 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  26.46 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  28.36 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  30 
 
 
121 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>