More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2275 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2275  integrase  100 
 
 
393 aa  810    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  76.34 
 
 
393 aa  600  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  44.17 
 
 
388 aa  292  5e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  42.28 
 
 
398 aa  289  6e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  29.27 
 
 
384 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.93 
 
 
363 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  31.5 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.63 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.78 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.75 
 
 
378 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.93 
 
 
370 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.02 
 
 
369 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25.18 
 
 
391 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.54 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  32.25 
 
 
373 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.03 
 
 
377 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.12 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  27.02 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.72 
 
 
400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  28.18 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  26.42 
 
 
443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.3 
 
 
385 aa  113  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.8 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.8 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.7 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  27.79 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.72 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  27.19 
 
 
381 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.75 
 
 
435 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.13 
 
 
392 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.08 
 
 
377 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  28.02 
 
 
442 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  28.02 
 
 
393 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.67 
 
 
391 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.03 
 
 
389 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.49 
 
 
387 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  27.16 
 
 
325 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.16 
 
 
386 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.07 
 
 
357 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  30.17 
 
 
370 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.48 
 
 
454 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  27.08 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  27.63 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.08 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.2 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  23.71 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.94 
 
 
451 aa  97.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  30.99 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.17 
 
 
376 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  28.65 
 
 
460 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.47 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.47 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  25.48 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  34.43 
 
 
209 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.43 
 
 
368 aa  93.2  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.62 
 
 
477 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  21.58 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  31.25 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  22.55 
 
 
367 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  33.52 
 
 
383 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  25.26 
 
 
402 aa  89.7  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  24.63 
 
 
409 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.44 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.39 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  25.88 
 
 
391 aa  87  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.25 
 
 
413 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  20.76 
 
 
403 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  28.2 
 
 
423 aa  86.3  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  24.7 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  23.26 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  24.46 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  23.65 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.63 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  35.43 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  25.23 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  31.22 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.42 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.71 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  24.26 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1417  integrase  25.69 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  26.89 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  36.41 
 
 
312 aa  82  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  28.74 
 
 
471 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  28.74 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  25.16 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  25.73 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  33.18 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  26.49 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  23.33 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  29.51 
 
 
429 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  23.55 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  25.86 
 
 
374 aa  79  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.51 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  25.63 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  22.59 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  24.04 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  24.14 
 
 
463 aa  76.3  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  25 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  23.92 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>