More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1885 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  100 
 
 		 356 aa  730    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  32.27 
 
 		 374 aa  189  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  31.03 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  29.18 
 
 		 375 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  31.77 
 
 		 312 aa  146  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1932  integrase/recombinase, phage associated  29.74 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.706433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  31.4 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  29 
 
 		 307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  31.62 
 
 		 308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  31.68 
 
 		 381 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  31.06 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  30.2 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  31.4 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  27.2 
 
 		 367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  24.51 
 
 		 387 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0572  integrase  26.95 
 
 		 372 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000288735  normal  0.557029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0634  integrase  26.95 
 
 		 372 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000314832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.13 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.22 
 
 		 374 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.22 
 
 		 374 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  30.39 
 
 		 369 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  29.44 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.79 
 
 		 377 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  29.5 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  29.83 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  27.3 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  29.36 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.59 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.26 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.93 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  25.44 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.74 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.25 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.09 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  23.76 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.52 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.14 
 
 		 477 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  28.25 
 
 		 402 aa  102  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  27.05 
 
 		 423 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  26.06 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  27.65 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.63 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.46 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  26.55 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.93 
 
 		 371 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.2 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.71 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.18 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  28.53 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  28.53 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.19 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  22.64 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  22.73 
 
 		 463 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.65 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.48 
 
 		 378 aa  92.8  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  24.72 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  23.65 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.39 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.34 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.34 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2582  integrase  28.13 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000812443  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.69 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  30.6 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  24.94 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  26.01 
 
 		 388 aa  87.4  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 388 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  24.1 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  24.1 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.92 
 
 		 325 aa  85.9  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  35.8 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  27.51 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  26 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  23.41 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  21.48 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  35.43 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  23.68 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  27.74 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.81 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.66 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.76 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.46 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  24.57 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  21.35 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.44 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  25.22 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  22.86 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  23.86 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  22.19 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  22.96 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.35 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>