More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1456 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  100 
 
 		 337 aa  702    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  27.73 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  26.01 
 
 		 371 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  27.93 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  25.53 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  26.07 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  28.1 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  28.32 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  25.79 
 
 		 394 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  27.25 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  28.28 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  26.48 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  27.08 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  26.18 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.85 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  26.13 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  32.55 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  24.85 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  25.68 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  25.58 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  24.85 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  25 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  27.39 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  27.04 
 
 		 276 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  30.81 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  25.37 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  25.08 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  29.23 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  25.22 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.59 
 
 		 411 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  23.53 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  25.88 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  27.3 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  25.58 
 
 		 350 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  23.08 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  26.67 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  24.93 
 
 		 341 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  25.58 
 
 		 343 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  25.58 
 
 		 338 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  26.67 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  24.54 
 
 		 387 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  25.56 
 
 		 314 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  24.29 
 
 		 412 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  24.51 
 
 		 397 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.64 
 
 		 222 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  23.12 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  24.47 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  26.44 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  23.57 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25 
 
 		 337 aa  90.1  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  25.44 
 
 		 387 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  23.84 
 
 		 353 aa  89.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  25.64 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  34.76 
 
 		 191 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  23.66 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  26.84 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  25 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  25.27 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  22.49 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.54 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  31.88 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.84 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  24.81 
 
 		 275 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  23.33 
 
 		 384 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  24.66 
 
 		 388 aa  86.3  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  29.77 
 
 		 258 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  22.82 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  24.37 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  25.29 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.59 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.27 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  23.75 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  27.44 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  27.56 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  24.37 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  24.16 
 
 		 531 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  21.97 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  24.32 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  21.91 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  22.67 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  23.76 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  26.41 
 
 		 387 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  25 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  29.03 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  25 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  28.91 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  29.03 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  29.38 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  24.6 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  24.9 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>