More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0939 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  100 
 
 		 357 aa  751    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  51.98 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  53.3 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  48 
 
 		 374 aa  364  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.22 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.53 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  26 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  26 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.71 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  31.09 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.82 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.23 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  28.96 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.61 
 
 		 376 aa  96.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.23 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.23 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.46 
 
 		 370 aa  96.3  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.33 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  28.45 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  28.13 
 
 		 348 aa  93.2  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.68 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.68 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.66 
 
 		 389 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.82 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.24 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.5 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  22.62 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  24.62 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  24.02 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  23.01 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  23.06 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  22.87 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  23.32 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  23.12 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  22.99 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.24 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  25.37 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.86 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.15 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.37 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  25.6 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.9 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.47 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.28 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.85 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  25.47 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.13 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.99 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  25.57 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.62 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  22.16 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  24.76 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.19 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  24.01 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  25.07 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  24.91 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  22.56 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  25.22 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  26.8 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.57 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  29.73 
 
 		 159 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  26.29 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  30.46 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  30.46 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  24.92 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.48 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  26.83 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  32.24 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  23.31 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.05 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  25.35 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  25 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  23.79 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  23.36 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.33 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  23.79 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  26.69 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.18 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  27.81 
 
 		 172 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  24.26 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  21.74 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.09 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  22.26 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  25.51 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  21.41 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  26.85 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  29.3 
 
 		 617 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  29.3 
 
 		 617 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  22.88 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  32.03 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  21.15 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>