More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0864 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  100 
 
 
349 aa  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  100 
 
 
349 aa  728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  29.43 
 
 
357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  26 
 
 
357 aa  99.8  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  24.38 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  24.2 
 
 
404 aa  95.9  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  29.12 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  23.08 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.79 
 
 
370 aa  94  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25 
 
 
363 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  22.91 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.54 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.69 
 
 
325 aa  89.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25.76 
 
 
367 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  28.61 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.71 
 
 
381 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  28.86 
 
 
373 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  25.2 
 
 
374 aa  87  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  28.03 
 
 
398 aa  86.7  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  21.16 
 
 
477 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.78 
 
 
392 aa  86.3  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.84 
 
 
370 aa  86.3  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  27.04 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.41 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.43 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.41 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  21.56 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.93 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.57 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  23.39 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  26.5 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  27.22 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.07 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.68 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.16 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.25 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  23.59 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.23 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  27.03 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  22.12 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.77 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.47 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  22.44 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.48 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.48 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  24.42 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  22.42 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  22.86 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  22.58 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.85 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  22.75 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  29.89 
 
 
209 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  21.78 
 
 
487 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  22.6 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.49 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  24.05 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  21.97 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  23.24 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  22.83 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.43 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  24 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  25.78 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  23.45 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  20.28 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.15 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  20.28 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  26.05 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  32.28 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  20.88 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  21.84 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  21.84 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  22.48 
 
 
376 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  23.7 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  22.32 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  24.07 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  21.81 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  21.53 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  22.37 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  22.51 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  25.87 
 
 
305 aa  67  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  27.17 
 
 
407 aa  67  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  25.38 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.27 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  26.82 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  25.61 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  22.66 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.3 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  23.86 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  24.54 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  25.14 
 
 
385 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  28.86 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  21.09 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  21.96 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  21.43 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  22.68 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  27.78 
 
 
285 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  25.74 
 
 
385 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.17 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.05 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  22.13 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>