More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4536 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  100 
 
 
409 aa  821    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  71.21 
 
 
201 aa  292  8e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  43.78 
 
 
403 aa  285  8e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2947  DNA integration/recombination/invertion protein  64.42 
 
 
177 aa  219  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  32.14 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  30.48 
 
 
369 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  30.46 
 
 
369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  35.26 
 
 
383 aa  182  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  34.96 
 
 
363 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  34.92 
 
 
368 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  30.2 
 
 
369 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  31.49 
 
 
442 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  35.55 
 
 
379 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  33.81 
 
 
387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  31.87 
 
 
388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  35.05 
 
 
377 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  29.28 
 
 
389 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  30.77 
 
 
392 aa  167  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.29 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.29 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  34.6 
 
 
378 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  30.05 
 
 
391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  32.5 
 
 
385 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.89 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.94 
 
 
370 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  33.82 
 
 
463 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  30.4 
 
 
435 aa  159  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.66 
 
 
390 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  29.48 
 
 
413 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  33.79 
 
 
414 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  34.61 
 
 
377 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  31.16 
 
 
400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  29.82 
 
 
393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  32.94 
 
 
477 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  28.84 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.57 
 
 
392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  33.43 
 
 
487 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.78 
 
 
373 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  30.03 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  29.1 
 
 
386 aa  141  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  31.23 
 
 
378 aa  139  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  32.91 
 
 
391 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  31.17 
 
 
416 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  31.69 
 
 
376 aa  133  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.84 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  31.95 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  33.33 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.35 
 
 
378 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  31.87 
 
 
404 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2948  putative phage integrase  62.39 
 
 
110 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  28.2 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.91 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.11 
 
 
443 aa  126  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.06 
 
 
376 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.06 
 
 
376 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  31.43 
 
 
422 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  31.93 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  32.72 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  32.72 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  29.46 
 
 
451 aa  119  7.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.63 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.72 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  28.7 
 
 
508 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  28.7 
 
 
508 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  25.87 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  30.7 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  30.86 
 
 
437 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  30.71 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.13 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  29.85 
 
 
357 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.57 
 
 
506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  26.84 
 
 
494 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  28.3 
 
 
374 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.95 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  28.77 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  26.16 
 
 
370 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  27.49 
 
 
362 aa  110  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  27.96 
 
 
443 aa  110  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  29.38 
 
 
492 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  30.54 
 
 
406 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.53 
 
 
416 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  36.29 
 
 
471 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  35.91 
 
 
471 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  28.68 
 
 
507 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  28.69 
 
 
371 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  28.66 
 
 
391 aa  100  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  30.96 
 
 
465 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  29.29 
 
 
656 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  25.37 
 
 
387 aa  96.7  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  32.94 
 
 
458 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  29.09 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  27.81 
 
 
426 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.15 
 
 
376 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.04 
 
 
392 aa  93.6  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  26.02 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  26.34 
 
 
395 aa  89.7  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  29.89 
 
 
402 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  24.63 
 
 
393 aa  89  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  24.37 
 
 
423 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  26.49 
 
 
398 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>