126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3437 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  100 
 
 		 458 aa  919    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  65.49 
 
 		 465 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  42.51 
 
 		 471 aa  300  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  42.29 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  34.26 
 
 		 377 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  33.07 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.63 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.83 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  33.75 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  33.75 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  34.29 
 
 		 403 aa  96.3  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  32.94 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  30.53 
 
 		 387 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.29 
 
 		 381 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.18 
 
 		 369 aa  94  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.28 
 
 		 383 aa  94  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  33.33 
 
 		 422 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  34.76 
 
 		 431 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.16 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.73 
 
 		 305 aa  91.7  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  30.12 
 
 		 404 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  22.19 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  34.27 
 
 		 477 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  27.31 
 
 		 325 aa  87  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.63 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.14 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  29.47 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.54 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.6 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.62 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.62 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  31.15 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.9 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  30.29 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  29.75 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.87 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.36 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  29.75 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.17 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  28.02 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  24.1 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  31.33 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  33.15 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  27.92 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  33.33 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  33.85 
 
 		 201 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  29.23 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.75 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.81 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  38.26 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  29.61 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.43 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  36.26 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  25.11 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.36 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  25.28 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.94 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.44 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.89 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.79 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  33.33 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  25.81 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25.21 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.76 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.76 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  28.85 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  38.16 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.78 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  28.85 
 
 		 209 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  33.33 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.86 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.87 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  30.13 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.71 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  33.04 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  28.21 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.83 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  25.21 
 
 		 507 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.25 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  28.25 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.91 
 
 		 443 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  26.97 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  25.98 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4093  GP41 protein  35.24 
 
 		 280 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  26.63 
 
 		 403 aa  53.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  26.25 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  22.26 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  26.04 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  22.65 
 
 		 398 aa  51.2  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  21.13 
 
 		 308 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  26.56 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  30.19 
 
 		 338 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  24.18 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  25.84 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.05 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>