More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1112 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  100 
 
 		 338 aa  696    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  37.39 
 
 		 369 aa  166  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  29.94 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  34.26 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  31.54 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.31 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  31.31 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.11 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  33.99 
 
 		 407 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.94 
 
 		 260 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  35.79 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  34.47 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  33.88 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.82 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  34.47 
 
 		 471 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  24.19 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  30.27 
 
 		 403 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  32.03 
 
 		 412 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  34.1 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  32.95 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 386 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  29.09 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.11 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  28.25 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  29.53 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  24.35 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.64 
 
 		 402 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  30.6 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  28.28 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  28.28 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  26.52 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  28.28 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.38 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  25.86 
 
 		 428 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.62 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  32.56 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.86 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  29.75 
 
 		 396 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  27.2 
 
 		 255 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.61 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  23.3 
 
 		 371 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  22.26 
 
 		 412 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  27.99 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  25 
 
 		 428 aa  87  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  28.57 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  23.54 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  27.74 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  29.41 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  30.74 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.74 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  23.26 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.41 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  23.26 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.86 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.15 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.17 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.5 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  23.54 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  23.68 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  23.54 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.97 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.52 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.52 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  26.13 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  26.13 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.55 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.71 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  25.76 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.5 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.76 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  25.81 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.06 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  28.99 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  24.69 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.08 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  23.73 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.39 
 
 		 400 aa  75.9  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.64 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.18 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  24.35 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25.43 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.84 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  25.5 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  25.4 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  22.64 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.05 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.79 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.79 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  26.18 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  22.3 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  28.02 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  23.49 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3648  phage integrase family protein  22 
 
 		 503 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215294  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.75 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>