More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1301 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  100 
 
 		 396 aa  821    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  34.34 
 
 		 357 aa  204  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  35.01 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  33.51 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  31.13 
 
 		 375 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  29.13 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  29.13 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  29.57 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2937  integrase, putative  53.6 
 
 		 139 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.456202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  27.65 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  28.19 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  27.7 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  27.45 
 
 		 411 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  28.78 
 
 		 411 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  27.45 
 
 		 411 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  29.48 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  28.14 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  26.2 
 
 		 428 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  25.78 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  27.41 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  27.41 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  27.41 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  25.07 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  30.06 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  30.35 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  26.3 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  26.07 
 
 		 431 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.96 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  26.7 
 
 		 412 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  27.27 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  26.37 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  26.5 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 407 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  29.84 
 
 		 255 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  28.92 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  29.93 
 
 		 341 aa  93.6  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  27.62 
 
 		 407 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.91 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.91 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  29.75 
 
 		 338 aa  90.9  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  29.46 
 
 		 368 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  26.83 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.32 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  27.65 
 
 		 403 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  26.23 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  28.42 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.76 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  26.26 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  25.49 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.12 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  25.47 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  28.69 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.51 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.16 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.74 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2749  hypothetical protein  64.41 
 
 		 73 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.56 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  24.56 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  29 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  24.51 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.51 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  23.08 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  24.02 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.02 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  28.92 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  27.39 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  30.51 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  27.65 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.06 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  26.41 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.6 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.6 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  25.82 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.92 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  28.79 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  33.54 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.34 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2835  hypothetical protein  64.81 
 
 		 54 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0848169  normal  0.131444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.97 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  31.05 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.05 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  30.05 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  25.31 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  26.6 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.06 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.97 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  22.83 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  23.21 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  26.99 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  25.17 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.66 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.24 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  28.45 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  25.43 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2523  Bbp50  63.83 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>