More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2264 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  100 
 
 		 428 aa  901    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  55.58 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  49.41 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  49.18 
 
 		 431 aa  443  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  49.65 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  49.06 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  49.41 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  49.41 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  46.48 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  38.94 
 
 		 411 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  38.94 
 
 		 411 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  39.18 
 
 		 411 aa  308  9e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  37.14 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  45.49 
 
 		 255 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  32.59 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  29.9 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  27.75 
 
 		 401 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  28.28 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  28.28 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  27.5 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  29.19 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  27.25 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  29.38 
 
 		 388 aa  136  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  29.57 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  26.32 
 
 		 411 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  26.8 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  25.78 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  25.25 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  28.06 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  25.99 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  24.69 
 
 		 412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  26.42 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  23.59 
 
 		 375 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.49 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  24.75 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.79 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  28.18 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  24.06 
 
 		 407 aa  106  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  25.54 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  31.44 
 
 		 292 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.87 
 
 		 414 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  26.73 
 
 		 357 aa  97.4  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  25.86 
 
 		 338 aa  97.1  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.05 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  26.22 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.72 
 
 		 363 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  27.27 
 
 		 393 aa  92.8  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.27 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  28.74 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.9 
 
 		 369 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  29.91 
 
 		 276 aa  89.7  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  28.74 
 
 		 273 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  25.76 
 
 		 385 aa  89.7  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.31 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.64 
 
 		 384 aa  86.7  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.38 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.22 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.17 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  25.2 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  23.84 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.21 
 
 		 325 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.16 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.22 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  21.48 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2141  hypothetical protein  44.44 
 
 		 140 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  24.14 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  32.02 
 
 		 190 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  23.48 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.43 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2290  putative transposase  51.72 
 
 		 68 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.417357  hitchhiker  0.0000000000265233 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  25 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  23.17 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  24.56 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  24.72 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  23.36 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  24.51 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  43.24 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.31 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.24 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.24 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  25 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  24.63 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  25.39 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  21.28 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  21.16 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  23.67 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  22.53 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.79 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  24.12 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  19.84 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.34 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  21.98 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  24.9 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>