125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1356 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  100 
 
 
388 aa  806    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  36.93 
 
 
430 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  36.93 
 
 
430 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  36.46 
 
 
431 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  31.83 
 
 
411 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  31.83 
 
 
411 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  31.83 
 
 
411 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  33.25 
 
 
402 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  33 
 
 
401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  31.25 
 
 
411 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  35.44 
 
 
341 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  32.79 
 
 
381 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  29.55 
 
 
426 aa  145  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  29.29 
 
 
431 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  28.75 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  29.38 
 
 
428 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  29.05 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  27.71 
 
 
428 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  29.12 
 
 
412 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  31.84 
 
 
375 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  31.78 
 
 
255 aa  119  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  26.02 
 
 
430 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  25.96 
 
 
446 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  25.96 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  26.01 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.76 
 
 
392 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  26.17 
 
 
407 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  27 
 
 
417 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  29.94 
 
 
403 aa  106  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  28.09 
 
 
356 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  26.14 
 
 
435 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  26.52 
 
 
386 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  26.96 
 
 
414 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  26.6 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  23.6 
 
 
401 aa  96.3  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  24.21 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  24.69 
 
 
433 aa  93.2  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  27.05 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  25.85 
 
 
391 aa  86.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  23.35 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.9 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  24.69 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  22.88 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  26.26 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  32.96 
 
 
424 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1930  phage integrase  30.43 
 
 
193 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  31.86 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  32.99 
 
 
190 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  24.46 
 
 
471 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  23.73 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  25.37 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25.86 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25.71 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.61 
 
 
363 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  28.81 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  24.05 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  29.52 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  26.94 
 
 
369 aa  63.2  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.18 
 
 
371 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  24.41 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  24.66 
 
 
292 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.68 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  27.27 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  24.07 
 
 
346 aa  59.3  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  23.7 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  24.81 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  21.93 
 
 
365 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  23.74 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  23.87 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.32 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  21.97 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  30.61 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  24.83 
 
 
396 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  26.28 
 
 
409 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  21.64 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  23.27 
 
 
357 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  23.53 
 
 
414 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 
362 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  21.41 
 
 
302 aa  51.2  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  22.9 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 
294 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  25.83 
 
 
314 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  28.35 
 
 
431 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  30.41 
 
 
391 aa  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  23.44 
 
 
426 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.1 
 
 
368 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  21.41 
 
 
297 aa  49.3  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.41 
 
 
297 aa  49.3  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  33.77 
 
 
257 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  25 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6370  integrase family protein  26.77 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  28.8 
 
 
385 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  27.93 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.14 
 
 
325 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2118  integrative genetic element Gsu21, integrase  27.27 
 
 
446 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  21.93 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  22.3 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  25.25 
 
 
311 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  23.49 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.35 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>