More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06819 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  100 
 
 		 341 aa  712    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  47.92 
 
 		 381 aa  292  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 430 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  33.33 
 
 		 430 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  34.72 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  35.44 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  33.54 
 
 		 401 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  36.13 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  29.19 
 
 		 428 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  31.79 
 
 		 411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  31.79 
 
 		 411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  31.79 
 
 		 411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  34 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  34 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  34 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  31.92 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  33.33 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  30.59 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  30.59 
 
 		 446 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  30.59 
 
 		 430 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  32.38 
 
 		 403 aa  122  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  32.93 
 
 		 411 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  31.93 
 
 		 255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  28.85 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  34.14 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  28.78 
 
 		 435 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  27.27 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  27.3 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  28.36 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  26.52 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  26.99 
 
 		 471 aa  99.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  27.7 
 
 		 412 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  28.32 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  27.43 
 
 		 401 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.9 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  29.83 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  29.93 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  26.59 
 
 		 403 aa  92.8  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  28.73 
 
 		 407 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  29.76 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  26.1 
 
 		 433 aa  88.2  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  28.63 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  25.52 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  27.54 
 
 		 411 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.39 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.32 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  24.2 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  23.82 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.56 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  25.17 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.17 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  25.99 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  26.96 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  31.94 
 
 		 190 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  24.09 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  24.09 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  32.37 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  26.81 
 
 		 405 aa  75.9  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  24.69 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  25.15 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  24.12 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  24.22 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  23.42 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.27 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  21.67 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  22.44 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.13 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.34 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.8 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25.34 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.91 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.21 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  23.91 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  26.84 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.76 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.03 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  28.47 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  23.53 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  26.32 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.97 
 
 		 381 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  23.04 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.57 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  24.34 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.3 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15950  site-specific recombinase XerD  28 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.182079  hitchhiker  0.000000384619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.89 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  27.06 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  21.14 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.01 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  21.74 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  27.51 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  23.94 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  25.86 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>