More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0179 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  97.99 
 
 
402 aa  814    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  832    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  33.82 
 
 
411 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  36.69 
 
 
375 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  35.19 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  47.56 
 
 
273 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  35.45 
 
 
356 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  33.99 
 
 
411 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  33.99 
 
 
411 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  33.99 
 
 
411 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  34.52 
 
 
430 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  34.52 
 
 
430 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  52.1 
 
 
190 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  31.51 
 
 
446 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  29.61 
 
 
426 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  34.51 
 
 
431 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  31.51 
 
 
446 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  31.51 
 
 
430 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  33 
 
 
388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  29.3 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  30.15 
 
 
428 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  30.3 
 
 
412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  30.69 
 
 
401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  30.87 
 
 
411 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  32.01 
 
 
403 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  30.46 
 
 
435 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  29.4 
 
 
391 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  28.77 
 
 
398 aa  154  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  29.78 
 
 
414 aa  154  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  29.38 
 
 
397 aa  151  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  33.54 
 
 
341 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  28.64 
 
 
412 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  27.57 
 
 
392 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  27.75 
 
 
428 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  27.57 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  34.4 
 
 
255 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  28.79 
 
 
471 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  29.33 
 
 
433 aa  144  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  27.86 
 
 
407 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  29.13 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  28.07 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  27.73 
 
 
386 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  27.51 
 
 
407 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  32.13 
 
 
357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  30.08 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  32.56 
 
 
381 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  30.13 
 
 
390 aa  125  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  29.6 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.31 
 
 
392 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  24.35 
 
 
338 aa  107  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  30.47 
 
 
292 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.77 
 
 
384 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.8 
 
 
363 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.62 
 
 
414 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  24.64 
 
 
359 aa  103  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.83 
 
 
368 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  29.57 
 
 
346 aa  99  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  25.18 
 
 
369 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.33 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  27.11 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.91 
 
 
369 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  26.12 
 
 
293 aa  96.3  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.52 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.02 
 
 
379 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.62 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.74 
 
 
369 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.55 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  26.5 
 
 
297 aa  93.6  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.5 
 
 
297 aa  93.6  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  25.96 
 
 
377 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  27.84 
 
 
325 aa  93.6  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.63 
 
 
260 aa  92.4  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  24.86 
 
 
384 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.83 
 
 
378 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.08 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  26.97 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.16 
 
 
386 aa  86.3  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.24 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.38 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  27.62 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  26 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  26.01 
 
 
368 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  32.02 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  24.36 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  26.08 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.21 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.15 
 
 
392 aa  77  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  24.53 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.76 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  30.57 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.34 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  25.96 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15950  site-specific recombinase XerD  25.14 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.182079  hitchhiker  0.000000384619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  23.45 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  27.14 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  23.78 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  25.89 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  23.23 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.03 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.57 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>