More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3468 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  100 
 
 
381 aa  784    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  98.16 
 
 
381 aa  772    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  97.13 
 
 
209 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3547  hypothetical protein  99.32 
 
 
156 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  36.14 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  36.14 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  34.18 
 
 
369 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  34.52 
 
 
390 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  33.05 
 
 
369 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  32.49 
 
 
369 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  31.07 
 
 
363 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  32.5 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  32.4 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  31.66 
 
 
435 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  33.88 
 
 
391 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  31.73 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  30.38 
 
 
386 aa  162  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.8 
 
 
385 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  29.94 
 
 
368 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  31.9 
 
 
381 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.15 
 
 
391 aa  155  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  33.14 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  29.23 
 
 
378 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  26.2 
 
 
463 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  31.15 
 
 
325 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  30.16 
 
 
383 aa  149  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  31.36 
 
 
400 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  29.86 
 
 
376 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.16 
 
 
377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.88 
 
 
376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.88 
 
 
376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.8 
 
 
377 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  32.51 
 
 
356 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.16 
 
 
477 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  29.1 
 
 
392 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  30.28 
 
 
373 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.48 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  31.53 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  28.81 
 
 
376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  31.21 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  31.87 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.56 
 
 
387 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  29.33 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  27.89 
 
 
388 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  32.19 
 
 
367 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.25 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  28.8 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.73 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  28.17 
 
 
423 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.47 
 
 
409 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  26.55 
 
 
403 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  25.62 
 
 
404 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.32 
 
 
391 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.27 
 
 
357 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  24.93 
 
 
379 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  24.93 
 
 
379 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  25.5 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  26.4 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.48 
 
 
413 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  27.46 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  25.35 
 
 
422 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  25.07 
 
 
422 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  28.92 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  28.39 
 
 
378 aa  116  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  26.84 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  27.55 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  26.84 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.68 
 
 
389 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  28.1 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  28.94 
 
 
506 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  26.55 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  24.3 
 
 
385 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  29.53 
 
 
310 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  23.33 
 
 
426 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  25.38 
 
 
443 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  24.6 
 
 
356 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  29.45 
 
 
374 aa  107  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0572  integrase  26.38 
 
 
372 aa  106  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000288735  normal  0.557029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0634  integrase  26.38 
 
 
372 aa  106  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000314832  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  29 
 
 
313 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  28.34 
 
 
393 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  22.33 
 
 
442 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  24.08 
 
 
397 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.85 
 
 
443 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  27.79 
 
 
354 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.78 
 
 
393 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.06 
 
 
451 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  29.08 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  29.08 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.15 
 
 
365 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  23.43 
 
 
387 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  27.22 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  27.39 
 
 
307 aa  97.1  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  26.39 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  28.48 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  23.02 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  23.6 
 
 
487 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  24.86 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  24.47 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>