More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15860 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  100 
 
 		 398 aa  796    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  31.66 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  32.8 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  29.71 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.89 
 
 		 381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  32.48 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.39 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  28.8 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  28.94 
 
 		 369 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.58 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  33.33 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.96 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  28.62 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.24 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.67 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  27.6 
 
 		 369 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  28.62 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.8 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  31.66 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.13 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  28.16 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.22 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.07 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.07 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.52 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.83 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  28.83 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  28.83 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  26.78 
 
 		 376 aa  96.3  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.81 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.09 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  23.18 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  25.32 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.72 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  30.55 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.71 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  22.91 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  22.39 
 
 		 386 aa  90.1  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  29.03 
 
 		 463 aa  89.7  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.25 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.91 
 
 		 374 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.91 
 
 		 374 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.9 
 
 		 387 aa  86.3  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  26.19 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.87 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  30.35 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.75 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  29.51 
 
 		 209 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  26.23 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  27.07 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  25.57 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  24.94 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.1 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  25.32 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  26.53 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  24.42 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  28.87 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  44.74 
 
 		 121 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1299  phage integrase family site specific recombinase  59.26 
 
 		 98 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  24.59 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.37 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.37 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  27.95 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.24 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.3 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  28.12 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2157  hypothetical protein  45.21 
 
 		 120 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00218836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2095  phage integrase  45.21 
 
 		 120 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2312  hypothetical protein  45.21 
 
 		 120 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.430324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2337  hypothetical protein  45.21 
 
 		 120 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  28.37 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  22.05 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  19.14 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  23.68 
 
 		 376 aa  67  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.17 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  24.78 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.49 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.2 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  31.03 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.76 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  25.62 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  24.57 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  26.02 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  26.2 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  25 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  27.12 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  26.7 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.15 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>