More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2540 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  100 
 
 
373 aa  769    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  43.4 
 
 
370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  36.49 
 
 
369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  35.96 
 
 
381 aa  236  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  36.55 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  36.22 
 
 
369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  36.22 
 
 
369 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  38.06 
 
 
374 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  38.06 
 
 
374 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  36.49 
 
 
392 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  37.47 
 
 
368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  35.49 
 
 
390 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  34.55 
 
 
383 aa  210  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  34.63 
 
 
388 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  32.55 
 
 
378 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  34.13 
 
 
370 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  32.98 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  34.02 
 
 
385 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  34.2 
 
 
378 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  32.69 
 
 
387 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  32.7 
 
 
379 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  31.46 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  34.53 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  30.32 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  32.81 
 
 
325 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.21 
 
 
477 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  31.39 
 
 
363 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  31.41 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  30.75 
 
 
400 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  33.84 
 
 
506 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  30 
 
 
386 aa  162  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  32.37 
 
 
391 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  31.25 
 
 
378 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  27.44 
 
 
391 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  28.96 
 
 
413 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.06 
 
 
376 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.06 
 
 
376 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  29.06 
 
 
376 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.57 
 
 
391 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  31.44 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  31.4 
 
 
305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  29.78 
 
 
389 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  27.51 
 
 
463 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  28.07 
 
 
357 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  30.26 
 
 
426 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  28.53 
 
 
384 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.39 
 
 
376 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  27.78 
 
 
409 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.93 
 
 
403 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  31.69 
 
 
393 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  31.69 
 
 
442 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  31.21 
 
 
381 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  28.27 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  30.72 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  27.73 
 
 
487 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  30.43 
 
 
379 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  30.43 
 
 
379 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  28.02 
 
 
398 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  32.25 
 
 
393 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.84 
 
 
451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.62 
 
 
377 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  32.54 
 
 
393 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  26.07 
 
 
404 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  28.78 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  29.43 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  28.97 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.21 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  26.51 
 
 
406 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  25.72 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  26.25 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  25.38 
 
 
416 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  29.48 
 
 
391 aa  116  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  26.02 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  28.45 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.68 
 
 
371 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  27.35 
 
 
354 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  25.24 
 
 
398 aa  113  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  37.02 
 
 
209 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  25.46 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  26.7 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  25.15 
 
 
422 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  23.96 
 
 
431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.69 
 
 
443 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  25.43 
 
 
381 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  26.82 
 
 
356 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  25.37 
 
 
503 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  26.41 
 
 
471 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  29.07 
 
 
356 aa  104  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  26.41 
 
 
471 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  29.57 
 
 
423 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25.53 
 
 
308 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  26.85 
 
 
407 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  26.59 
 
 
437 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  27.46 
 
 
399 aa  102  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  22.31 
 
 
460 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  25.25 
 
 
438 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.28 
 
 
365 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  23.61 
 
 
508 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  23.61 
 
 
508 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  25.57 
 
 
376 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>