More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0217 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 384 aa  796    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  35.04 
 
 		 362 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  29.1 
 
 		 370 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  29.19 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  28.84 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  28.61 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  30.86 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  32.84 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  29.27 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  28.61 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  27.46 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  28.53 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  29.53 
 
 		 386 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  28.99 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  29.76 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.33 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.69 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  27.47 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  28.95 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.87 
 
 		 374 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.87 
 
 		 374 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.27 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.23 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.52 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  23.87 
 
 		 388 aa  123  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.9 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  27.35 
 
 		 374 aa  116  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.98 
 
 		 414 aa  116  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  25 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.44 
 
 		 454 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  27.86 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.18 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  27.86 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.18 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.4 
 
 		 363 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  28.07 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.43 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.17 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.64 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.72 
 
 		 376 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.59 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  25.57 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.95 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.39 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  24.38 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  25.77 
 
 		 401 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.91 
 
 		 388 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.77 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  26.05 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  25.6 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  28.17 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  25.89 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  23.74 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.07 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  24.53 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  26.47 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.15 
 
 		 377 aa  99.8  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.34 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  27.67 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  24.02 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  28.45 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  24.29 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  26.09 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  23.35 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.96 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.17 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  25.62 
 
 		 487 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  24.33 
 
 		 431 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.17 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  30.81 
 
 		 201 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  23.39 
 
 		 357 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  22.78 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.71 
 
 		 443 aa  93.2  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  22.26 
 
 		 402 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  27.81 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  31.8 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.5 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  22.84 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  23.66 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1417  integrase  25.24 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  24.47 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.4 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  27.15 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.88 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  26.99 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  31.31 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  28.48 
 
 		 307 aa  87.4  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  24.83 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1679  integrase  25.6 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  26.64 
 
 		 428 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>