More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1190 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  100 
 
 
463 aa  944    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  43.31 
 
 
404 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  36.06 
 
 
370 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.11 
 
 
374 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.11 
 
 
374 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  30.73 
 
 
369 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  30.48 
 
 
369 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  28.46 
 
 
369 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  34.33 
 
 
383 aa  193  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  33.51 
 
 
387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  30.32 
 
 
391 aa  190  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  32.98 
 
 
477 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  33.68 
 
 
414 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.89 
 
 
390 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  32.26 
 
 
656 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  34.33 
 
 
487 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  30.32 
 
 
435 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  31.71 
 
 
379 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  30.02 
 
 
494 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  32.49 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  32.49 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  31.22 
 
 
383 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  29.51 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  31.19 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  28.15 
 
 
370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  34.33 
 
 
378 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  30.18 
 
 
442 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.18 
 
 
378 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  31.55 
 
 
368 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  33.57 
 
 
409 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.97 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  29.68 
 
 
400 aa  163  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  34.63 
 
 
377 aa  163  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.97 
 
 
381 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  28.05 
 
 
392 aa  159  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  30.49 
 
 
388 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  30.06 
 
 
325 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  30.46 
 
 
363 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  30.96 
 
 
377 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  29.23 
 
 
389 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  33 
 
 
426 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.05 
 
 
373 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  30.53 
 
 
393 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  30.08 
 
 
416 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  26.2 
 
 
381 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.2 
 
 
381 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  30.3 
 
 
431 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  31.82 
 
 
305 aa  143  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  28.43 
 
 
403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  30.51 
 
 
391 aa  140  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  32.25 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  29.63 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.22 
 
 
391 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  32.55 
 
 
492 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  30.55 
 
 
422 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  31.36 
 
 
402 aa  133  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  30.87 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  31.25 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  28.26 
 
 
471 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  27.97 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  30.03 
 
 
371 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  26.08 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.84 
 
 
379 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.84 
 
 
379 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  28.53 
 
 
422 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  29.58 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  27.33 
 
 
445 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  27.33 
 
 
445 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.11 
 
 
443 aa  120  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  28.02 
 
 
506 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  24.66 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  26.42 
 
 
437 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.05 
 
 
378 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.91 
 
 
376 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.91 
 
 
376 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  26.88 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  37.09 
 
 
201 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.9 
 
 
376 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.94 
 
 
451 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.17 
 
 
376 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  28.49 
 
 
407 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.38 
 
 
384 aa  104  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25.66 
 
 
367 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  22.52 
 
 
413 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  23.99 
 
 
399 aa  101  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  31.52 
 
 
209 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.04 
 
 
376 aa  100  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  26.49 
 
 
374 aa  100  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  27.75 
 
 
380 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.59 
 
 
365 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  24.7 
 
 
443 aa  97.8  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  27.89 
 
 
383 aa  97.8  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  23.87 
 
 
503 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  23.76 
 
 
388 aa  96.7  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.52 
 
 
387 aa  96.3  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  25.34 
 
 
345 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  25.34 
 
 
345 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  22.2 
 
 
356 aa  92.4  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.17 
 
 
393 aa  92  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  28.94 
 
 
398 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>