More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26510 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  100 
 
 
443 aa  911    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  42.96 
 
 
451 aa  343  4e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  34.27 
 
 
460 aa  228  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.6 
 
 
370 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.93 
 
 
435 aa  136  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.57 
 
 
413 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.68 
 
 
363 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.01 
 
 
378 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.7 
 
 
385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.51 
 
 
374 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.51 
 
 
374 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  29.02 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  27.34 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.51 
 
 
389 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  28.02 
 
 
378 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.41 
 
 
391 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.91 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.25 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.82 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.26 
 
 
388 aa  120  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  27.71 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.72 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.57 
 
 
386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.99 
 
 
414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.85 
 
 
379 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  26.42 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.72 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.19 
 
 
383 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.06 
 
 
377 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.84 
 
 
393 aa  110  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  27.96 
 
 
409 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.94 
 
 
391 aa  109  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.89 
 
 
400 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.31 
 
 
385 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.68 
 
 
377 aa  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.75 
 
 
477 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.55 
 
 
369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.55 
 
 
369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.38 
 
 
381 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.6 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.87 
 
 
376 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.69 
 
 
398 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  27.68 
 
 
305 aa  104  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.62 
 
 
388 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.13 
 
 
381 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.93 
 
 
325 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  24.7 
 
 
463 aa  98.2  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  30.42 
 
 
438 aa  98.2  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.06 
 
 
387 aa  97.1  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.41 
 
 
379 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.41 
 
 
379 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.19 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.19 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.43 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  21.56 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.17 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  26.4 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.32 
 
 
386 aa  90.1  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  24.94 
 
 
367 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.57 
 
 
392 aa  86.7  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.77 
 
 
454 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  24.82 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  31.11 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  31.11 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  24.62 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  23.65 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  25.34 
 
 
487 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25.63 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  25.39 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  21.63 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  24.16 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  24.32 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  24.34 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.74 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  25.39 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  24.94 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  25.57 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  27.85 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  37.04 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  25.58 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  22.14 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  24.87 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  25.37 
 
 
422 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.77 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.36 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  24.87 
 
 
376 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  22.42 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  36.53 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  40.48 
 
 
121 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  24.45 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  26.47 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  27.14 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.33 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.12 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  24.87 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  33.15 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  20.68 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  24.08 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  21.37 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  25.68 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>