More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0044 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 376 aa  788    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  99.2 
 
 		 376 aa  780    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  99.2 
 
 		 376 aa  783    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  98.4 
 
 		 376 aa  778    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  35.31 
 
 		 411 aa  202  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  34.64 
 
 		 397 aa  199  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  33.68 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  33.68 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  33.61 
 
 		 393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  30.1 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  30.1 
 
 		 451 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  29.84 
 
 		 451 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  30.1 
 
 		 456 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.3 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  28.12 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  26.8 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  26.68 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.5 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  25.51 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  25.51 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.08 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 451 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  24.81 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  24.8 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  24.88 
 
 		 452 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  24.42 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  24.02 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  25.39 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  25 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  23.99 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 420 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  23.92 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  25.95 
 
 		 463 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  26.1 
 
 		 452 aa  106  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  24.29 
 
 		 399 aa  106  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  24.03 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  26.57 
 
 		 430 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  24.21 
 
 		 451 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  23.96 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  23.96 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  25.48 
 
 		 432 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  28.83 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.54 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  28.72 
 
 		 396 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  26.73 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  27.12 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.53 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 443 aa  86.3  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  30.87 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  26.44 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  24.75 
 
 		 421 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  24.87 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.5 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  25.41 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  22.76 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.88 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.29 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.2 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25.44 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  26.6 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  26.1 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  23.55 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  25.57 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  24.62 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  22.97 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.47 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  23.89 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  24.71 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.06 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  28.32 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  23.83 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  21.87 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.74 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  29.02 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  25 
 
 		 449 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  23.75 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  22.77 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.79 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  25 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  24.11 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  23.47 
 
 		 453 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  26.12 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  24.52 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  24.52 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  23.75 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  28.5 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.67 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.17 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  27.6 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  21.94 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  23.66 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>