More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0805 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  100 
 
 		 396 aa  824    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  95.96 
 
 		 482 aa  769    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  37.44 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.31 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  29.04 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  32.95 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  29.62 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  28.47 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  28.13 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  29.97 
 
 		 397 aa  143  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  29.11 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  30.19 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  28.53 
 
 		 337 aa  124  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  31.89 
 
 		 353 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  36.32 
 
 		 251 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  27.2 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  29.11 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  31.8 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  28.61 
 
 		 421 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  26.61 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  27.81 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  25.8 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  26.12 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  23.47 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  27.25 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  32.12 
 
 		 451 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  31.25 
 
 		 456 aa  106  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  28.8 
 
 		 368 aa  106  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  28.09 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  31.37 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  27.1 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.18 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  30.9 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  26.25 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  27.25 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  26.82 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  28.46 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  27.66 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  28.72 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  25.98 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  28.72 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  26.51 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  26.46 
 
 		 452 aa  103  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  26.38 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  26.67 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  26.61 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  24.25 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  31.97 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.65 
 
 		 412 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  27.73 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  23.98 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.22 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  25.51 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  25.44 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  25.45 
 
 		 451 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.96 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  25.74 
 
 		 367 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  25.5 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  29.93 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  25.5 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 396 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  26.71 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  25.5 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  25.5 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  25.5 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  25.56 
 
 		 397 aa  97.1  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 449 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  24.72 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  24.72 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  25.62 
 
 		 412 aa  96.7  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  29.04 
 
 		 330 aa  96.3  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  24.72 
 
 		 404 aa  96.3  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  26.21 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  28.42 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  25.14 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  24.43 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  26.21 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  24.85 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  24.85 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.51 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  25.67 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30.16 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  40.65 
 
 		 159 aa  94.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  23.58 
 
 		 452 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  25.93 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  26.11 
 
 		 387 aa  94  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  25.71 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  26.69 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.86 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.22 
 
 		 394 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  31.38 
 
 		 415 aa  93.2  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  25.22 
 
 		 396 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>