More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1761 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  100 
 
 		 361 aa  722    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  37.8 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  34.83 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  35.28 
 
 		 427 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  33.23 
 
 		 433 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  34.54 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  34.97 
 
 		 437 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  31.48 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  33.33 
 
 		 414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  30.32 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  35.14 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  30.84 
 
 		 413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  31.78 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  32.14 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  32.01 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  29.68 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  32.17 
 
 		 413 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  36.52 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  31.98 
 
 		 425 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  30.33 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  29.8 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  31.21 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  30.64 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00841  integrase  30.65 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  29.8 
 
 		 410 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  33.66 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  31.31 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  32.45 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  28.87 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  30.42 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  29.67 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  30.03 
 
 		 422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 432 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  29.86 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  31.6 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  29.48 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  28.05 
 
 		 453 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  29.26 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  28.57 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  29.26 
 
 		 409 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  30.67 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  27.71 
 
 		 403 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  29.58 
 
 		 409 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.45 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  28.77 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  32.31 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  30.74 
 
 		 450 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  29.61 
 
 		 440 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  29.39 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  31.79 
 
 		 418 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  31.79 
 
 		 418 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  34.08 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  30.58 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  29.77 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  31.56 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  27.63 
 
 		 481 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  30.34 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  30.22 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  31.29 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  27.87 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  29.43 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  30.98 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1277  putative phage integrase  27.22 
 
 		 454 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  28.9 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  30.14 
 
 		 515 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  30.98 
 
 		 467 aa  96.3  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  28.01 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3239  integrase family protein  29.61 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0978515  normal  0.26506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  28.93 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  28.06 
 
 		 387 aa  93.2  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5552  integrase family protein  30.82 
 
 		 424 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  28.78 
 
 		 418 aa  92.8  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  26.67 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1028  Phage integrase  30.47 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214982  normal  0.0128497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  29.58 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  28.41 
 
 		 443 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  28.87 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 443 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  26.98 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  26.03 
 
 		 448 aa  90.1  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  27.08 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  26.32 
 
 		 347 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 347 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  27.88 
 
 		 418 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  25.07 
 
 		 413 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  29.97 
 
 		 482 aa  89.4  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  26.86 
 
 		 400 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  29.28 
 
 		 396 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  27.33 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  27.8 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  25.08 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  28.73 
 
 		 443 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  28.47 
 
 		 399 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  25.98 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  25.98 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  27.27 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>