More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0399 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  100 
 
 		 337 aa  701    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  39.65 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  35.61 
 
 		 353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  36.95 
 
 		 251 aa  152  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  31.53 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  33.33 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  31.8 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  31.38 
 
 		 482 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  28.22 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  30.68 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  27.67 
 
 		 354 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  36.17 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  33.2 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  32.03 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  30.06 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.97 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.97 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  32.41 
 
 		 401 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  32.98 
 
 		 222 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  29.17 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  27.71 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  27.71 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  29.14 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  29.36 
 
 		 335 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  33 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  32.51 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  29.11 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  30.56 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  33 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  30.39 
 
 		 451 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  24.71 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  26.25 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  26.43 
 
 		 348 aa  96.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  27.41 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  26.56 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.87 
 
 		 429 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  28.01 
 
 		 356 aa  96.3  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  32.24 
 
 		 412 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  26.52 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  28.91 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  29.54 
 
 		 386 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  29.46 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  31.05 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  26.86 
 
 		 434 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  27.88 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  32.22 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  32.11 
 
 		 413 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  27.24 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  31.79 
 
 		 368 aa  92.8  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  28.23 
 
 		 384 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  26.93 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  32.54 
 
 		 412 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  32.34 
 
 		 384 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  30.17 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  32.79 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  29.13 
 
 		 451 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25 
 
 		 337 aa  90.1  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  26.1 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.69 
 
 		 388 aa  89.7  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  26.69 
 
 		 331 aa  89.4  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  26.69 
 
 		 331 aa  89.4  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  35.66 
 
 		 159 aa  89.4  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  36.05 
 
 		 172 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  25.28 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  31.28 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  25.27 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  23.86 
 
 		 378 aa  87  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  25.27 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  29.37 
 
 		 451 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 451 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  32.14 
 
 		 395 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  25.46 
 
 		 381 aa  86.3  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  25.08 
 
 		 452 aa  85.9  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  25.23 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  32.84 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  28.62 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  27.64 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  33.56 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  35.95 
 
 		 571 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  32.82 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  30.86 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  30.6 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  26.95 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  31.75 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  25.49 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  26.38 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  26.44 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  31.21 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  26.44 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  26.44 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  24.32 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  32.35 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  32.84 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  26.59 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>