More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1522 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 339 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  88.5 
 
 		 339 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  48.28 
 
 		 332 aa  325  6e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  43.57 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  45.63 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  41.55 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  41.62 
 
 		 330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  39.83 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  38.62 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  38.79 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  42.9 
 
 		 323 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  41.04 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  41.16 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  40.17 
 
 		 413 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  38.83 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  40.46 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  37.68 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  39.88 
 
 		 347 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  39.88 
 
 		 347 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  40.06 
 
 		 351 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  40.11 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  37.25 
 
 		 354 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  36.14 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  38.54 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  38.19 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  35.33 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  36.05 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  39.83 
 
 		 222 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  36.67 
 
 		 374 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  33.43 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  36.58 
 
 		 374 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  36.73 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  30.99 
 
 		 334 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  29.75 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  34.43 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  33.88 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  30.59 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  33.52 
 
 		 380 aa  122  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  28.49 
 
 		 381 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  30.79 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  29.77 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  30.27 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  25.74 
 
 		 571 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  28.03 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  30.17 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  30.17 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.62 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  25.37 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  31.47 
 
 		 286 aa  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  29.48 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  28.61 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  29.51 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  28.11 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2576  integrase family protein  28.37 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.478177  hitchhiker  0.000378812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2610  integrase family protein  28.37 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  28.67 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  25.44 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  30.4 
 
 		 359 aa  96.3  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  27.3 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  26.35 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  27.52 
 
 		 365 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  25.68 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  29.24 
 
 		 397 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  25.41 
 
 		 531 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  30.09 
 
 		 251 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  26.67 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.11 
 
 		 379 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 365 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 402 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.48 
 
 		 412 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  30.6 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  22.67 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.37 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  26.2 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.48 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  30.74 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.78 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  28.12 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1622  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  28.44 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.33 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.72 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  25.08 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  27.35 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  22.87 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  26.55 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  28.32 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  26.82 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  26.93 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  28.63 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  28.74 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.39 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  25.94 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.78 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>