More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0832 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  100 
 
 		 341 aa  707    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  40.72 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  42.36 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  42.36 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  42.36 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  42.36 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  42.18 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  40.87 
 
 		 369 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  36.51 
 
 		 387 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  36.24 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  36.81 
 
 		 387 aa  225  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  36.81 
 
 		 387 aa  225  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  36.81 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  35.04 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  35.99 
 
 		 386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  35.64 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  40.82 
 
 		 276 aa  205  8e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  33.06 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  41.05 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  29.78 
 
 		 364 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  30.54 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  30.54 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  29.69 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  31.12 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  26.56 
 
 		 386 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3904  phage integrase family site specific recombinase  54.55 
 
 		 122 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.908319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  30.49 
 
 		 429 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  31.51 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  33.03 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 367 aa  99.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  27.41 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.72 
 
 		 412 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  27.01 
 
 		 401 aa  95.9  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  29.21 
 
 		 421 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  30.29 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  27.78 
 
 		 337 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  27.6 
 
 		 329 aa  92.8  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4065  integrase family protein  28.16 
 
 		 394 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  32.48 
 
 		 172 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1546  prophage DLP12 integrase  50 
 
 		 128 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1723  prophage DLP12 integrase  50 
 
 		 128 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.241784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  34.25 
 
 		 159 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  24.92 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1525  phage integrase family site specific recombinase  51.76 
 
 		 132 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  31.37 
 
 		 275 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20500  Phage integrase  25.71 
 
 		 399 aa  86.3  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  28.98 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  24.91 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  26.99 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.23 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  28.87 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.21 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  28.08 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6962  integrase family protein  28.4 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3473  integrase family protein  25.54 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  30.18 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  30.67 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  29.67 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  25.09 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  24.76 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  29.79 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  28.57 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  28.29 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  25.08 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  26.64 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  22.12 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  26.64 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  25.45 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  25.14 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  30.67 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  30.04 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1727  phage integrase  28.38 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  29.74 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  27.34 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  28.63 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  26.16 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  33.8 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  31.22 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  27.67 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  27.52 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  25.82 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1637  integrase  30.91 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  29.3 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  26.79 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0017  integrase family protein  24.86 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  27.05 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  28.57 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  30.17 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  23.87 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1565  phage integrase  28.11 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  27.18 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  29.75 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  30.17 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>