More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0807 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  100 
 
 		 323 aa  657    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  46.13 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  41.8 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  38.39 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  42.9 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  41.05 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  38.39 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  40.9 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  40.45 
 
 		 354 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  38.53 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  37.61 
 
 		 373 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  37.61 
 
 		 348 aa  192  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  38.7 
 
 		 338 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  38.11 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  39.38 
 
 		 340 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  39.23 
 
 		 374 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  38.76 
 
 		 222 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  38.46 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  38.1 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  36.2 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  33.55 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  33.94 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  32 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  36.53 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  37.3 
 
 		 374 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  35.4 
 
 		 413 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  35.67 
 
 		 351 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  36.98 
 
 		 374 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  36.25 
 
 		 380 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  37.16 
 
 		 375 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  34.45 
 
 		 347 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  34.45 
 
 		 347 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  36.11 
 
 		 366 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  37.62 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  33.33 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  31.13 
 
 		 571 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  30.59 
 
 		 531 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  31.17 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  31.97 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  29.07 
 
 		 381 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  28.4 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  30 
 
 		 353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  29.25 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  32.91 
 
 		 251 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  33.09 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  29.03 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2435  integrase family protein  30.21 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.061585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.73 
 
 		 402 aa  99.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  29.48 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.77 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  30.68 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  30.56 
 
 		 364 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2576  integrase family protein  30.03 
 
 		 338 aa  95.9  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.478177  hitchhiker  0.000378812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2610  integrase family protein  30.03 
 
 		 338 aa  95.9  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 351 aa  95.9  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  29.46 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.35 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.35 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  26.92 
 
 		 278 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  26.19 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  31.49 
 
 		 204 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  32.92 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  26.73 
 
 		 429 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  30.55 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.74 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  26.69 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.67 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  30.52 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  40.12 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  26.83 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  25 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  30.19 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  26.65 
 
 		 368 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  24.11 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.89 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  23.64 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  30.49 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  37.75 
 
 		 146 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1622  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  25.1 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  26.96 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  27.61 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  30.86 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  27.46 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.14 
 
 		 482 aa  72.8  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  28.1 
 
 		 386 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  27.86 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.83 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  24.92 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1009  shufflon-specific DNA recombinase  39.68 
 
 		 111 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173474  hitchhiker  0.000000000551255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.37 
 
 		 412 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  24.69 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  30.51 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.96 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1909  integrase family protein  25.8 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838759  hitchhiker  0.00000212902 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  25.38 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>