More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7637 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  100 
 
 		 425 aa  848    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  44.68 
 
 		 430 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  40.76 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  42.9 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  43.34 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  31.57 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  29.36 
 
 		 476 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2451  putative integrase/recombinase  29.95 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.84 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  36.78 
 
 		 251 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  26.16 
 
 		 421 aa  96.3  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4350  integrase family protein  28.21 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  26.47 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  31.6 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  26.8 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  25.97 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.82 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  34.08 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  34.39 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  34.08 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  25.77 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  25.77 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  34.59 
 
 		 172 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  27.62 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  31.63 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  28.36 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  28.36 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  28.36 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  22.49 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  28.36 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  28.29 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  33.91 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  29.96 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  28.12 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  29.7 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  27.27 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  29.24 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  34.48 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  33.74 
 
 		 159 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  28.24 
 
 		 275 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  30.04 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3119  integrase family protein  27.21 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  28.7 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  29.46 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.73 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  28 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  26.1 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  30.35 
 
 		 331 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  30.35 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.54 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.9 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  26.91 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  30.32 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  26.24 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  26.05 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28.44 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  27.98 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  24.3 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  27.42 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  23.33 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  27.76 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.1 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  29.23 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.78 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  27.49 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  29.11 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  25.81 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  25 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  27.87 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  27.85 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  29.83 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.59 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  28.57 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  26.3 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.25 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 		 294 aa  67  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  30.12 
 
 		 328 aa  67  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  28.57 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.63 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  31.13 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30.3 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.95 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  26.23 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  29.05 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  26.34 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.84 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0017  integrase family protein  25 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.84 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  21.33 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  26.38 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  25.46 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  32.14 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  24.67 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  32.28 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  24.75 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.73 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  26.19 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  26.61 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>