More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2865 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  100 
 
 		 417 aa  857    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  32.63 
 
 		 409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  32.01 
 
 		 407 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  30.36 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  30 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  26.96 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.79 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.28 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  23.46 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.89 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.22 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  21.99 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.7 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.54 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.93 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  27.25 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.55 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.55 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  26.04 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  28.3 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.77 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  21.22 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  23.91 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.33 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.41 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  23.4 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  24.79 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  26.52 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  25.76 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  26.36 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  26.17 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  26.17 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  25.53 
 
 		 340 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  23.06 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  27.78 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.01 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  27.31 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  25.38 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  24.33 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  23.52 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  27.6 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  26.84 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.09 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  24.65 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  22.31 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.33 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  28.02 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  28.02 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  27.7 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  26.67 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  25.49 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  29.17 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2334  integrase family protein  23.39 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.74243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  25 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  22.15 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.2 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  23.1 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  23.24 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.52 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  27.2 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  21.71 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  25.19 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  25.24 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  28.31 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.15 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.13 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.64 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  22.93 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  23.1 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.56 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  23.1 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  23.17 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  24.03 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  26.29 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.37 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  23.56 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  25.51 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  25.53 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  22 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  24.77 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.46 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  22.57 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  25.12 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  28.57 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  25.46 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  23.17 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  26.34 
 
 		 372 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  24.81 
 
 		 306 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>