More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  100 
 
 		 338 aa  697    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  53.71 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  43.99 
 
 		 336 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  43.19 
 
 		 341 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  43.92 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  41.69 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  41.94 
 
 		 338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  42.01 
 
 		 350 aa  271  9e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  42.9 
 
 		 341 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  45.24 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  40.88 
 
 		 345 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  41.42 
 
 		 339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  40.23 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  42.35 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  39.17 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  42.09 
 
 		 314 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  43.32 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  41.95 
 
 		 394 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  38.44 
 
 		 371 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  40.43 
 
 		 318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  36.99 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  43.44 
 
 		 332 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  37.57 
 
 		 345 aa  235  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  40.06 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  46.47 
 
 		 258 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  38.81 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  38.84 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  39.02 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  37.76 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  37 
 
 		 336 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  38.23 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  39.25 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  36.26 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  36.56 
 
 		 337 aa  196  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  50.27 
 
 		 191 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63440  bacteriophage integrase  60.71 
 
 		 126 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  66.67 
 
 		 164 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0372474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  51.28 
 
 		 121 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1313  putative integrase  38.42 
 
 		 172 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0718359  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  27.08 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  32.34 
 
 		 407 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  30.86 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  26.56 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  31.5 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  28.74 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  30.59 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  29.04 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.89 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  28.63 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  27.91 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  27.76 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  29.83 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  29.72 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  28.03 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  27.94 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  29.91 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  24.37 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  29.39 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  28.03 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  27.94 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.51 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  29.11 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  29.55 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2420  integrase family protein  26.44 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0132691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  26.1 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  28.18 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  27.46 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.39 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  29.02 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  29.02 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  32.73 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  29.77 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  27.69 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.94 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  27.41 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  32.73 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.02 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  26.05 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.95 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  28.7 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  28.7 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  27.68 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  25 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.08 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.75 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>