More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2981 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  100 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3924  integrase family protein  47.78 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.733894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  33.33 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1185  integrase family protein  33.22 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  30.43 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  29.65 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2420  integrase family protein  32.19 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0132691 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  31.56 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  25.65 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  27.85 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  27.85 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  27.85 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2540  integrase family protein  25.55 
 
 		 350 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.31 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  27.43 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.45 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  23.89 
 
 		 335 aa  92.4  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1515  integrase family protein  25.76 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  23.08 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.95 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  27.49 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.78 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  27.03 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  26.19 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  25.53 
 
 		 307 aa  85.9  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  22.79 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3501  integrase family protein  26.03 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  25.91 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  23.23 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.22 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  25.53 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.09 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  27.94 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  27.94 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  27.94 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  26.55 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  24.07 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.81 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.81 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.1 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  25.08 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1619  integrase family protein  24.5 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.771515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  26.72 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  27.03 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  26.76 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  27.07 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.97 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.43 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.78 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.97 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  27.74 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.35 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.35 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.79 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0211  site-specific recombinase, phage integrase family  27.87 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.62 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  24.27 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.43 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  25.17 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  27.08 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1555  tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.2 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  24.72 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  24.72 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  24.72 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.59 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  24.72 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  22.78 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  23.35 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  23.1 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  23.64 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.17 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  27.16 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  25.82 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  25.27 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  27.27 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  25.12 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.17 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.17 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.17 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.17 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  24.04 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  24.68 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  22.89 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  24.75 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  23.23 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  24.34 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>