More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3701 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  100 
 
 		 392 aa  784    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  49.34 
 
 		 451 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  45.03 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  41.34 
 
 		 387 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  36.07 
 
 		 275 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.89 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  29.39 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 282 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  26.3 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  31.06 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  33.75 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.66 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  26.91 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.73 
 
 		 290 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.61 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  30.04 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.06 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  31.78 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.14 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  27.23 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.85 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  27.68 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.85 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  27.23 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  27.68 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.03 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  27.96 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  31.21 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  30.45 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  25.87 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  31.77 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  27.94 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  27.99 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  32.95 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  30.42 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.01 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.51 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.21 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.01 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  25.72 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  32.56 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  27.25 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  32.35 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.63 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.63 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  29.94 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.63 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.63 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.63 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  29.24 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.73 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  31.23 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 		 304 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  25.08 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  27.82 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  26.45 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  25.3 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.37 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  28.74 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.21 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.24 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  31.84 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  31.42 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  29.22 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.89 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  27.23 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  28.29 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  27 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  31.79 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  26.83 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.89 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  33.56 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  25.98 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  32.63 
 
 		 189 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  24.13 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0221  phage integrase  33.56 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.118358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  32.27 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  30.38 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.28 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  28.12 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  29.56 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  30.74 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  27.88 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1673  integrase family protein  25.15 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.18 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  35.29 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  28.44 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  32.43 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  30.17 
 
 		 172 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.42 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>