More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2647 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  100 
 
 		 315 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  89.61 
 
 		 308 aa  596  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  89.29 
 
 		 308 aa  594  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  64.24 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  34.41 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  31.76 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  33.95 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  33.05 
 
 		 335 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  30.53 
 
 		 451 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  29.65 
 
 		 258 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  30.26 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  29.3 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.65 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  30.19 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  27.21 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  35.54 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  29.83 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  28.74 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  30 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  28.4 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  28.06 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  33.53 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  30.37 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  31.05 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  30.48 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.46 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  32.35 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  33.02 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  33.94 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  33.96 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  29.63 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  28.43 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  34.26 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  28.15 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.87 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  28.15 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  31.58 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  27.78 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  29 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  27.5 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  34.81 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  34.23 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  34.23 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  27.78 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  31.42 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  28.46 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  27.5 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  27.31 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  27.31 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  30.67 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  26.81 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  31.43 
 
 		 371 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  29.52 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  31.17 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  26.98 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  27.11 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  27.39 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  28.8 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  25.68 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  25.46 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  26.27 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  35 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.51 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  26.81 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  27.83 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  29.64 
 
 		 424 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  26.25 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  29.69 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  26.01 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  25.68 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  28.95 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  31.08 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  30.38 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  26.17 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  26.98 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  27.8 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  34.53 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  29.07 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  28.11 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.23 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  30.82 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  25.87 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  26.25 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  29.88 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  29.44 
 
 		 444 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  28.87 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  28.37 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  28.12 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  28.24 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  27.19 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  27.09 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>