More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53570 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  100 
 
 
258 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  54.81 
 
 
335 aa  275  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  48.57 
 
 
405 aa  232  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  46.47 
 
 
338 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  48.97 
 
 
336 aa  228  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  47.22 
 
 
335 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  44.76 
 
 
345 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  46.94 
 
 
335 aa  208  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  47.79 
 
 
332 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  44.53 
 
 
314 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  44.53 
 
 
338 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  44.53 
 
 
343 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  44.53 
 
 
350 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  42.69 
 
 
394 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  46.37 
 
 
352 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  44.36 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  44.66 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  43.78 
 
 
333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  44.8 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  42.34 
 
 
336 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  43.53 
 
 
343 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  42.98 
 
 
334 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  42.34 
 
 
313 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  44.26 
 
 
318 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  40.77 
 
 
371 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  41.8 
 
 
375 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  40.32 
 
 
336 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  46.93 
 
 
191 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  39.33 
 
 
327 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  37.55 
 
 
331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  40.17 
 
 
337 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  37.05 
 
 
345 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  37.55 
 
 
326 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  36.61 
 
 
347 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  37.4 
 
 
326 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63440  bacteriophage integrase  59.82 
 
 
126 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  58.04 
 
 
121 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  59.26 
 
 
164 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0372474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  31.98 
 
 
367 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  29.34 
 
 
429 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  29.65 
 
 
315 aa  85.9  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  29.77 
 
 
337 aa  85.9  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  30.88 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  30.88 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  25.88 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.85 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1313  putative integrase  45.68 
 
 
172 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0718359  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  27.03 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  25.22 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  25.54 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.35 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  27.15 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  28.7 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  28.63 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  29.91 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  29.91 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  29.79 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  27.95 
 
 
329 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  27.17 
 
 
365 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  26.07 
 
 
401 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  31.8 
 
 
331 aa  68.6  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  31.8 
 
 
331 aa  68.6  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  29.28 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  27.17 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.12 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  24.23 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  27.47 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  25.56 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  30.66 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  25.97 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.7 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  26.72 
 
 
451 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  32.18 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.05 
 
 
379 aa  65.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  29.51 
 
 
331 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  27.47 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  28.66 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.51 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  27.63 
 
 
301 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  29.95 
 
 
343 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.77 
 
 
300 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  28.15 
 
 
381 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  28.33 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  31.22 
 
 
370 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  28.42 
 
 
311 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  28.57 
 
 
411 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 
313 aa  63.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  34.15 
 
 
425 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.86 
 
 
353 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.12 
 
 
282 aa  63.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  28.5 
 
 
320 aa  62.8  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  25.83 
 
 
412 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 
321 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  27.75 
 
 
295 aa  62  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  23.18 
 
 
297 aa  62  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  27.08 
 
 
347 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  31.45 
 
 
172 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  28.25 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0928  integrase family protein  29.06 
 
 
326 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.669409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>